drttoolbox : matlab toolbox for dimensionality reduction是laurens van der maaten資料降維的工具箱。
裡面囊括了幾乎所有的資料降維演算法：
- principal component analysis ('pca')
- linear discriminant analysis ('lda')
- independent component analysis ('ica')
- multidimensional scaling ('mds')
- isomap ('isomap')
- landmark isomap ('landmarkisomap')
- locally linear embedding ('lle')
- locally linear coordination ('llc')
- laplacian eigenmaps ('laplacian')
- hessian lle ('hessianlle')
- local tangent space alignment ('ltsa')
- diffusion maps ('diffusionmaps')
- kernel pca ('kernelpca')
- generalized discriminant analysis ('kernellda')
- stochastic neighbor embedding ('sne')
- neighborhood preserving embedding ('npe')
- linearity preserving projection ('lpp')
- stochastic proximity embedding ('spe')
- linear local tangent space alignment ('lltsa')
- ****** pca ('spca')
- conformal eigenmaps ('cca', implemented as an extension of lle)
- maximum variance unfolding ('mvu', implemented as an extension of lle)
- fast maximum variance unfolding ('fastmvu')
- autoencoders using rbm pretraining ('autoencoder')
- autoencoders using evolutionary optimization ('autoencoderea')
在此寫下我在使用中遇到的一點點小問題。
首先安裝工具箱，一般都把工具箱發到matlab預設放置工具箱的目錄 matlabroot\toolbox\下面，拷貝過去之後，記得修改matlabroot\toolbox\local 下的pathdef.m檔案，要在裡面新增上新的工具箱的路徑：
matlabroot,'\toolbox\drtoolbox;', ...
matlabroot,'\toolbox\drtoolbox\techniques;', ...
具體參加說明文件。
在使用『isomap』演算法時，會遇到錯誤如下：
invalid mex-file c:\program files\matlab\r2010b\toolbox\drtoolbox\techniques\dijkstra.dll 找不到指定模組
發現相應路徑中，dijkstra.dll的檔案是在的，於是以為是環境變數或者progam files空格的問題，嘗試修改均無效。
後來仔細閱讀了原始檔的注釋才發現是編譯版本問題。dijkstra函式是用c++實現的，需要用matlab的mex編譯器編譯成dll呼叫。雖然工具箱中已經有相應編譯的dijkstra.dll，但不同版本的matlab呼叫會遇到問題，需要重新編譯。
在windows命令列cmd中，用cd命令更改路徑到工具箱路徑下，執行命令：
mex -o dijkstra.cpp1) cannot open include file 'iostream.h' : no such file or directory
修改dijkstra.cpp中 include為
2） 『cout』 : undeclared identifier 『cin』 : undeclared identifier
在dijsktra.cpp中加入一行 using namespace std;
編譯成功之後，在techniques資料夾下出現dijkstra.mexw32 的檔案，即為新編譯的dll。我們可以修改之前的為dijkstra.dll.old，重新命名dijkstra.mexw32為dijkstra.dll。
在matlab環境中執行isomap的程式：
成功！
Matlab 資料降維工具箱drtoolbox
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matlab優化工具箱
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Matlab統計工具箱
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