R語言讀入資料

2021-06-22 03:07:31 字數 2460 閱讀 5413

一、   r 匯入文字檔案

r中匯入資料的基本命令是scan()。比較常用的命令有read.table()、read.csv()、read.fwf()等,這些命令其實在內部也是通過呼叫scan()實現的,它們可以看作是scan()的簡化。

r從使用分界符的文字(delimited text)讀取資料到資料框的命令為read.table()。關於此文字的格式,有以下要求:

讀取符合以上要求的文字檔案的最簡單的命令為:

mydata <- read.table("mydata.txt")

儲存資料為文字檔案的命令為write.table()。最簡單的用法為:

write.table(mydata, file="mydata.txt")

1.1    csv格式

最常見的一種資料文字檔案格式為csv(comma separated value)檔案,採用逗號作為分界符,第一行為變數名,第一列為id,缺失值用空格表示。讀取csv檔案的命令為:

mydata <- read.table("mydata.csv", header=true, sep=",", row.names="id", na.strings=" ")

r中也有專門的讀取csv檔案的命令read.csv()。一般的用法為:

mydata <- read.csv("mydata.csv", row.names="id", na.strings=" ")

1.2    定寬格式

從定寬(fixed-width)格式讀取資料的命令為read.fwf()。定寬格式中只有資料值,沒有變數名,資料列之間沒有分界符。每一列資料的寬度一定。例如:

mydata <- read.fwf(file="mydata.txt", width=c(1,1,2), col.names=c("id","gender","age"), row.names="id")

read.fwf()其實在內部是首先將定寬文字讀入、分割列,然後呼叫read.table()來實現的。

另外,read.fortran()讀入的是按fortran的規範來格式化的定寬文字檔案。

1.3     dif格式

從資料交換格式(dif, data interchange format)讀取資料的命令為read.dif()。

excel的剪貼簿就是使用這種格式來儲存資料的,因此可以用這一命令來讀取剪貼簿中的excel資料,其最簡單的呼叫為:

mydata <- read.dif("clipboard")

1.4    指定資料列

因為r的所有資料運算都在記憶體中執行,節省記憶體空間在實踐中是非常重要的。在讀入資料後,所有的資料都被放入記憶體。為了節省記憶體的使用,在讀取資料時就應當有選擇地唯讀入對當前任務有用的資料。

read.table()函式可以通過colclasses引數來實現對資料列的選擇。colclasses引數引用乙個字元向量。colclasses引數的本意是設定每一列的數值型別,但是可以通過設定null型別來跳過不需要的資料列。比如:

mydata <- read.table("mydata.txt", colclasses=c("integer", "character", "null", "logical"))

通過使用上面的命令,讀取的資料就跳過了資料檔案中的第3列。使用colclasses引數必須指明每一列的型別。使用colclasses引數可以大幅提公升資料的讀入速度。

在讀取定寬文字檔案(fixed-width file)時選擇列的方法是設定列寬為負數。例如:

mydata <- read.fwf(file="mydata.txt", width=c(1,-1,2), col.names=c("id","gender","age"), row.names="id")

通過使用上面的命令,讀取的資料就跳過了資料檔案中的第2列。

1.5    使用scan()命令

read.table()和read.fwf()都是通過呼叫scan()來實現的。在某些時候直接使用scan()可以更快速的讀取資料。

比如讀入乙個200*2000的數值矩陣可以採用:

mymatrix <- matrix(scan("matrix.dat", n = 200*2000), 200, 2000, byrow = true)

如果用read.table()那麼其命令為:

mymatrix <- as.matrix(read.table("matrix.dat"))

第二種方式所花的時間是第一種方式的10倍。

scan()命令中使用what引數來設定所讀入的資料型別,設定恰當的what引數可以大幅提高資料的讀入速度。

scan()命令還能從鍵盤讀入資料。

可使用foreign包匯入外部格式的資料。

二、  r 匯入其它統計軟體的資料

r 匯入二進位制檔案:使用readbin()和writebin()函式來讀寫。

可以使用foreign包來匯出資料。匯出資料的命令為write.foreign()。

也可使用hmisc包匯入外部格式的資料。

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