drop low-quality alignments: each alignment is given a quality score (mapq) which is equivalent to phred scores (with respect to determining relative quality of different alignments). you can screen for low-quality alignments when you convert from sam to bam
files using samtools view.
上面提到了丟棄低質量的比對，那麼什麼是低質量的比對，我們應該如何去判斷那？
在輸出的sam檔案中第五列mapq（被稱為比對質量的乙個值）
sam所明書上對mapq的解釋是：
那麼當我們想把sam檔案中第5列小於2的都丟棄，那麼應該怎麼做
這裡samtools為我們提供了乙個方法：
samtools view -bsq 2 file.sam > filtered.bam-q int skip alignments with mapq smaller than int [0]
70後 80後 90後的區別
工作狂基本上都是70後的。80後拒絕加班！90後拒絕上班！2 70後喜歡穿七匹狼或者猛龍牌子的衣服。80後喜歡g star之類的。90後乞丐服，越花越好，越破越好。乙個洞時尚，兩個洞潮流，三個洞個性。3 70後唱k的時候只會 例如2002年的第一場雪，然後就拼命拉著你喝酒，不讓你唱。mic霸一般是8...
70後 80後 90後的離奇區別
1 70後 工作狂基本上都是70後的。80後 而我們，拒絕加班！90後 拒絕上班！2 70後 他們喜歡穿七匹狼或者猛龍牌子的衣服。80後 我們喜歡g star之類的。90後 乞丐服，越花越好,越破越好.乙個洞時尚，兩個洞潮流，三個洞個性.3 70後 他們唱k的時候只會亂吼 例如2002年的第一場雪，...
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1 70後 工作狂基本上都是70後的。80後 而我們，拒絕加班！90後 拒絕上班！2 70後 他們喜歡穿七匹狼或者猛龍牌子的衣服。80後 我們喜歡g star之類的。90後 乞丐服，越花越好,越破越好.乙個洞時尚，兩個洞潮流，三個洞個性 3 廣告 70後 他們唱k的時候只會亂吼 例如2002年的第一...