DNA微陣列資料

2021-07-06 08:46:45 字數 888 閱讀 5350

生物微陣列又被廣泛地稱為生物晶元,其技術的關鍵點是將巨大的dna分析縮小到晶元上,在利用光電技術對訊號進行探測,最後通過計算機加以分析,

借助基因晶元技術,研究者可以測定基因在某一器官、不同條件下、不同發展階段和不同組織中的轉錄水平,從而建立基因表達譜以描繪基因組中每乙個基因的表達水平。

各種微陣列技術中,用的最多的當屬基因微陣列晶元,再基於基因微陣列的試驗中,首先選取來自不同狀態的樣本,如正常組織與腫瘤組織,不同發育階段的組織。用藥前與用藥後的組織等。

gene

sample1

sample2

sample3

sample4

......

samplen

gene1

1.154

1.824

2.708

1.574

...0.847

gene2

0.037

1.662

1.857

2.447

...1.254

gene3

0.178

-0.578

0.142

-1.485

...0.214

gene4

-1.354

-1.854

-1.849

-0.872

...-0.751

......

......

......

...genen

1.342

0.421

0.454

0.218

...1.154

基因表達格式

行向量表示i基因在n個條件下的表達水平,稱為基因i的表達譜。

列向量表示在條件j下各個基因的表達水平。

什麼是DNA微陣列技術?

dna微陣列 dna microarray 也叫寡核苷酸陣列 oligonucleitide array 是人類基因組計畫 human geneome project,hgp 的逐步實施和分子生物學的迅猛發展及運用的產物,它是生物學家受到計算機晶元製造和廣為應用的啟迪,融微電子學 生命科學 電腦科學...

TJOI2017 DNA 字尾陣列

加里敦大學的生物研究所,發現了決定人喜不喜歡吃藕的基因序列s,有這個序列的鹼基序列就會表現出喜歡吃藕的性狀,但是研究人員發現對鹼基序列s,任意修改其中不超過3個鹼基,依然能夠表現出吃藕的性狀。現在研究人員想知道這個基因在dna鏈 s 上的位置。所以你需要統計在乙個表現出吃藕性狀的人的dna序列 s ...

TJOI2017 DNA 字尾陣列求LCP

給定乙個文字串和乙個模式串,求文字串中有多少個連續的子串和模式串相差不超過三個字元。算是一道字尾陣列的模板題。直接做lcp,然後遇到匹配不上的就跳,跳的次數不能超過三次。具體地,將兩個字串連在一起,中間加乙個分隔符,然後求出height,用rmq維護height陣列的區間最小值即可。author y...