HDFS小檔案問題及解決方案

2021-07-10 08:24:58 字數 3722 閱讀 1239

1、  概述

小檔案是指檔案size小於hdfs上block大小的檔案。這樣的檔案會給hadoop的擴充套件性和效能帶來嚴重問題。首先,在hdfs中,任何block,檔案或者目錄在記憶體中均以物件的形式儲存,每個物件約佔150byte,如果有1000 0000個小檔案,每個檔案占用乙個block,則namenode大約需要2g空間。如果儲存1億個檔案,則namenode需要20g空間(見參考資料[1][4][5])。這樣namenode記憶體容量嚴重制約了集群的擴充套件。 其次,訪問大量小檔案速度遠遠小於訪問幾個大檔案。hdfs最初是為流式訪問大檔案開發的,如果訪問大量小檔案,需要不斷的從乙個datanode跳到另乙個datanode,嚴重影響效能。最後,處理大量小檔案速度遠遠小於處理同等大小的大檔案的速度。每乙個小檔案要占用乙個slot,而task啟動將耗費大量時間甚至大部分時間都耗費在啟動task和釋放task上。

本文首先介紹了hadoop自帶的解決小檔案問題的方案(以工具的形式提供),包括hadoop archive,sequence file和combinefileinputformat;然後介紹了兩篇從系統層面解決hdfs小檔案的**,一篇是中科院計算所2023年發表的,用以解決hdfs上儲存地理資訊小檔案的方案;另一篇是ibm於2023年發表的,用以解決hdfs上儲存ppt小檔案的方案。

2、  hdfs檔案讀寫流程

在正式介紹hdfs小檔案儲存方案之前,我們先介紹一下當前hdfs上檔案訪問的基本流程。

(1)  讀檔案流程

1)client端傳送讀檔案請求給namenode,如果檔案不存在,返回錯誤資訊,否則,將該檔案對應的block及其所在datanode位置傳送給client

2) client收到檔案位置資訊後,與不同datanode建立socket連線並行獲取資料。

(2) 寫檔案流程

1) client端傳送寫檔案請求,namenode檢查檔案是否存在,如果已存在,直接返回錯誤資訊,否則,傳送給client一些可用datanode節點

2) client將檔案分塊,並行儲存到不同節點上datanode上,傳送完成後,client同時傳送資訊給namenode和datanode

3)  namenode收到的client資訊後,傳送確信資訊給datanode

4)  datanode同時收到namenode和datanode的確認資訊後,提交寫操作。

3、  hadoop自帶的解決方案

對於小檔案問題,hadoop本身也提供了幾個解決方案,分別為:hadoop archive,sequence file和combinefileinputformat。

(1) hadoop archive

hadoop archive或者har,是乙個高效地將小檔案放入hdfs塊中的檔案存檔工具,它能夠將多個小檔案打包成乙個har檔案,這樣在減少namenode記憶體使用的同時,仍然允許對檔案進行透明的訪問。

對某個目錄/foo/bar下的所有小檔案存檔成/outputdir/ zoo.har:

hadoop archive -archivename zoo.har -p /foo/bar /outputdir

當然,也可以指定har的大小(使用-dhar.block.size)。

har是在hadoop file system之上的乙個檔案系統,因此所有fs shell命令對har檔案均可用,只不過是檔案路徑格式不一樣,har的訪問路徑可以是以下兩種格式:

har://scheme-hostname:port/archivepath/fileinarchive

har:///archivepath/fileinarchive(本節點)

可以這樣檢視har檔案存檔中的檔案:

hadoop dfs -ls har:///user/zoo/foo.har

輸出:har:///user/zoo/foo.har/hadoop/dir1

har:///user/zoo/foo.har/hadoop/dir2

使用har時需要兩點,第一,對小檔案進行存檔後,原檔案並不會自動被刪除,需要使用者自己刪除;第二,建立har檔案的過程實際上是在執行乙個mapreduce作業,因而需要有乙個hadoop集群執行此命令。

此外,har還有一些缺陷:第一,一旦建立,archives便不可改變。要增加或移除裡面的檔案,必須重新建立歸檔檔案。第二,要歸檔的檔名中不能有空格,否則會丟擲異常,可以將空格用其他符號替換(使用-dhar.space.replacement.enable=true 和-dhar.space.replacement引數)。

(2) sequence file

sequence file由一系列的二進位制key/value組成,如果為key小檔名,value為檔案內容,則可以將大批小檔案合併成乙個大檔案。

hadoop-0.21.0中提供了sequencefile,包括writer,reader和sequencefilesorter類進行寫,讀和排序操作。如果hadoop版本低於0.21.0的版本,實現方法可參見[3]。

(3)combinefileinputformat

combinefileinputformat是一種新的inputformat,用於將多個檔案合併成乙個單獨的split,另外,它會考慮資料的儲存位置。

4、  小檔案問題解決方案

上一節中提到的方案均需要使用者自己編寫程式,每隔一段時間對小檔案進行merge以便減少小檔案數量。那麼能不能直接將小檔案處理模組嵌到hdfs中,以便自動識別使用者上傳的小檔案,然後自動對它們進行merge呢?

本節介紹了兩篇**針試圖在系統層面解決hdfs小檔案問題。這兩篇**對不同的應用提出了解決方案,實際上思路類似:在原有hdfs基礎上新增乙個小檔案處理模組,當乙個檔案到達時,判斷該檔案是否屬於小檔案,如果是,則交給小檔案處理模組處理,否則,交給通用檔案處理模組處理。小檔案處理模組的設計思想是,先將很多小檔案合併成乙個大檔案,然後為這些小檔案建立索引,以便進行快速訪問和訪問。

**[4]針對webgis系統的特點提出了解決hdfs小檔案儲存的方案。webgis是結合web和地理資訊系統(gis)而誕生的一種新系統。在webgis中,為了使瀏覽器和伺服器之間傳輸的資料量盡可能地少,資料通常被切分成kb的小檔案儲存在分布式檔案系統中。**結合webgis中資料相關性特徵,將儲存相鄰地理位置資訊的小檔案合併成乙個大的檔案,並為這些小檔案建立索引以便對小檔案進行訪問。

該**將size小於16mb的檔案當做小檔案,需將它們合併成64mb(預設的block size),並建立索引,索引結構和檔案儲存方式見上圖。索引方式是一般的定長hash索引。

下圖展示的是在bluesky中上傳檔案的過程:

下圖展示的是在bluesky中閱覽檔案的過程:

5、  總結

hadoop目前還沒有乙個系統級的通用的解決hdfs小檔案問題的方案。它自帶的三種方案,包括hadoop archive,sequence file和combinefileinputformat,需要使用者根據自己的需要編寫程式解決小檔案問題;而第四節提到的**均是針對特殊應用提出的解決方案,沒有形成乙個比較通用的技術方案。

6、  參考資料

(1)有關小檔案問題的表述:

(2)hadoop sequence file:

(3)英文書籍《hadoop:the definitive guide》,第七章190頁

(4)xuhui liu, jizhong han, yunqin zhong, chengde han, xubin he: implementing webgis on hadoop: a case study of improving small file i/o performance on hdfs. cluster 2009: 1-8

,作者介紹:

HDFS小檔案問題及解決方案

1 概述 小檔案是指檔案size小於hdfs上block大小的檔案。這樣的檔案會給hadoop的擴充套件性和效能帶來嚴重問題。首先,在hdfs中,任何block,檔案或者目錄在記憶體中均以物件的形式儲存,每個物件約佔150byte,如果有1000 0000個小檔案,每個檔案占用乙個block,則na...

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HDFS小檔案危害以及解決方案

1 hdfs不適合大量小檔案的儲存,因namenode將檔案系統的元資料存放在記憶體中,因此儲存的檔案數目受限於 namenode的記憶體大小。hdfs中每個檔案 目錄 資料塊占用150bytes。如果存放的檔案數目過多的話會占用很大的記憶體甚至撐爆記憶體 2 hdfs適用於高吞吐量,而不適合低時間...