一、防止php木馬執行webshell
開啟safe_mode， 在，php.ini中設定 disable_functions=passthru，exec，shell_exec，system二者選一即可，也可都選。
二、防止跳出web目錄
首先修改httpd.conf，如果你只允許你的php指令碼程式在web目錄裡操作，還可以修改httpd.conf檔案限制php的操作路徑。比如你的web目錄是/usr/local/apache/htdocs，那麼在httpd.conf裡加上這麼幾行：php_admin_value open_basedir /usr/local/apache/htdocs，如果指令碼要讀取/usr/local/apache/htdocs以外的檔案將不會被允許，如果錯誤顯示開啟的話會提示這樣的錯誤：warning: open_basedir restriction in effect. file is in wrongdirectory in /usr/local/apache/htdocs/open.php on line 4等等。
三、防止php木馬讀寫檔案目錄
在php.ini中的 disable_functions= passthru，exec，shell_exec，system後面加上php處理檔案的函式，主要有fopen，mkdir，rmdir，chmod，unlink，dir，fopen，fread，fclose，fwrite，file_exists，closedir，is_dir，readdir.opendir，fileperms.copy，unlink，delfile。即成為 disable_functions=passthru，exec，shell_exec，system，fopen，mkdir，rmdir，chmod，unlink，dir，fopen，fread，fclose，fwrite，file_exists，closedir，is_dir，readdir.opendir ，fileperms.copy，unlink，delfile。
ok，大功告成，php木馬拿我們沒轍了，遺憾的是這樣的話，利用文字資料庫的那些東西就都不能用了。如果是在windos平台下搭建的apache還需要注意一點，apache預設執行是system許可權，必須給apache降降許可權，如下：
net user apache f**kmicrosoft/add
net localgroup users apache /del
此時建立了乙個不屬於任何組的使用者apche，只要開啟計算機管理器-服務-apache服務的屬性-log on-thisaccount，在這裡填入上面所建立的賬戶和密碼，重啟apache服務即可實現apache執行在低許可權下。
總結：實際上還可以通過設定各個資料夾的許可權，給每乙個目錄建立乙個單獨能讀寫的使用者，來實現安全。當前很多虛擬主機提供商的流行配置方法，不過這種方法用於防止這裡就顯的有點大材小用了。只要我們管理員有安全意識，相對的禁閉不用的功能就可以保證網路安全的威脅。
phpinfo()
功能描述：輸出 php 環境資訊以及相關的模組、web 環境等資訊。
危險等級：中
passthru()
功能描述：允許執行乙個外部程式並回顯輸出，類似於 exec()。
危險等級：高
exec()
功能描述：允許執行乙個外部程式（如 unix shell 或 cmd 命令等）。
危險等級：高
system()
功能描述：允許執行乙個外部程式並回顯輸出，類似於 passthru()。
危險等級：高
chroot()
功能描述：可改變當前 php 程序的工作根目錄，僅當系統支援 cli 模式
php 時才能工作，且該函式不適用於 windows 系統。
危險等級：高
scandir()
功能描述：列出指定路徑中的檔案和目錄。
危險等級：中
chgrp()
功能描述：改變檔案或目錄所屬的使用者組。
危險等級：高
chown()
功能描述：改變檔案或目錄的所有者。
危險等級：高
shell_exec()
功能描述：通過 shell 執行命令，並將執行結果作為字串返回。
危險等級：高
proc_open()
功能描述：執行乙個命令並開啟檔案指標用於讀取以及寫入。
危險等級：高
proc_get_status()
功能描述：獲取使用 proc_open() 所開啟程序的資訊。
危險等級：高
error_log()
功能描述：將錯誤資訊傳送到指定位置（檔案）。
安全備註：在某些版本的 php 中，可使用 error_log() 繞過 php safe mode，
執行任意命令。
危險等級：低
ini_alter()
功能描述：是 ini_set() 函式的乙個別名函式，功能與 ini_set() 相同。
具體參見 ini_set()。
危險等級：高
ini_set()
功能描述：可用於修改、設定 php 環境配置引數。
危險等級：高
ini_restore()
功能描述：可用於恢復 php 環境配置引數到其初始值。
危險等級：高
dl()
功能描述：在 php 進行執行過程當中（而非啟動時）載入乙個 php 外部模組。
危險等級：高
pfsockopen()
功能描述：建立乙個 internet 或 unix 域的 socket 持久連線。
危險等級：高
syslog()
功能描述：可呼叫 unix 系統的系統層 syslog() 函式。
危險等級：中
readlink()
功能描述：返回符號連線指向的目標檔案內容。
危險等級：中
symlink()
功能描述：在 unix 系統中建立乙個符號鏈結。
危險等級：高
popen()
功能描述：可通過 popen() 的引數傳遞一條命令，並對 popen() 所開啟的檔案進行執行。
危險等級：高
stream_socket_server()
功能描述：建立乙個 internet 或 unix 伺服器連線。
危險等級：中
putenv()
功能描述：用於在 php 執行時改變系統字符集環境。在低於 5.2.6 版本的 php 中，可利用該函式
修改系統字符集環境後，利用 sendmail 指令傳送特殊引數執行系統 shell 命令。
危險等級：高
禁用方法如下：
開啟/etc/php.ini檔案，
查詢到 disable_functions ，新增需禁用的函式名，如下：
phpinfo,eval,passthru,exec,system,chroot,scandir,chgrp,chown,shell_exec,proc_open,
proc_get_status,ini_alter,ini_alter,ini_restore,dl,pfsockopen,openlog,syslog,readlink,symlink,popepassthru,
stream_socket_server,fsocket,fsockopen
刪掉
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