在amber教程中給出了相關的教程，具體流程都是根據這個教程來製作的。
但是他的電荷使用的是bcc電荷，但是並沒有介紹如何把電荷轉換為resp。
流程：2.antechamber -fi ccif -i cro.cif -bk cro -fo ac -o cro_step1.ac -at amber #和教程上一致，目的為了生成參照的ac檔案，-at 必須制定，否則原子型別預設gaff；
3.antechamber -fi gout -i cro.log -rn cro -fo ac -o cro_step2.ac -c resp -at amber #賦予resp電荷到新的ac檔案中；
4.文字操作將cro_step2.ac中的座標以及電荷資訊列覆蓋到cro_step1.ac中，同時修改主鏈n原子的原子型別從nt到n，儲存為cro_step3.ac；
5.製作mc檔案，格式如下圖，參照cro_step3.ac檔案製作；
6.prepgen -i cro_step3.ac -o cro.prepin -m cro.mc -rn cro #得到主鏈資訊檔案；
7.parmchk2 -i cro.prepin -f prepi -p frcmod.cro -a y -p $amberhome/dat/leap/parm/parm10.dat #檢查生成的引數資訊，檢視frcmod檔案，若其中出現某一行引數為0且有 "attn,need revision" 標識則說明在parm10.dat中引數不完整需要用gaff進行補充；
8.grep -v "attn" frcmod.cro > frcmod1.cro #剔除不包含的引數，其餘存成引數檔案；
9.parmchk2 -i cro.prepin -f prepi -o frcmod2.cro #剩餘的引數利用gaff生成引數，由於命令中沒有指定 "-a y" 則只生成了原力場中未包含的引數檔案；
10.在leap中匯入檔案即可，loadamberprep cro.prepin ，loadamberparams frcmod1.cro ,loadamberparams frcmod2.cro ,對蛋白無需額外處理，（需要去除h，pdb4amber）。
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