1.分組，匯入資料
2，組一組二畫路徑圖，amos中，在任何乙個群組中畫模型圖，結果都是一樣的。
3.如果不同群組路徑圖不一樣時勾選
view-inte***ce properties-misc--allow different path diagrams for different groups
4.設定輸出結果
5.不分組時
分組時，男女組，年齡組：選擇多組分析
6.執行
analyze--calculate estimate
7.報表解讀
view--text output
<0.08,越小越好
gfi（goodness-of-fit index, 擬合優度指數）,
nnfi（non-normed fit index）
cfi(comparative fit index, 比較擬合指數).
轉錄組分析 轉錄組分析 使用STAR進行比對
通過二代測序我們可以獲得150bp左右的reads，如果想要知道reads是從哪個轉錄本上測出來的，就需要將reads比對到參考基因組上。比對的演算法很複雜，但簡單理解就是看reads與基因組上哪個區域一致。wget c 解壓 star tar xvzf 2.7.3a.tar.gz 執行 star ...
轉錄組分析處理流程
1.fastqc 2.star build index star runthreadn 9 runmode genomegenerate genomedir data xx bio task le mir 03 2mirseq index genomefastafiles data xxbio ta...
轉錄組分析 高階轉錄組分析和R資料視覺化
常規轉錄組是我們最常接觸到的一種高通量測序資料型別，其實驗方法成熟，花費較低，是大部分cns必備的技術，以後應該就如做個pcr一樣常見。而且分析思路簡潔清晰，是入門生信，學習生信分析思路和資料視覺化的首選。資料分析是相通的，通過乙個簡單的課程理解其中的原理，就可以推而廣之，延伸到其它型別的資料分析，...