Linux下手動編譯安裝R包(今日份收穫)

2021-08-25 11:05:36 字數 588 閱讀 8269

不管是在windows下還是linux下,我們安裝r包的方法最常用最無腦的方法,自然是install.packages("package_name"),但是很多情況下並不能如願:

本人今天安裝asmap包時也失敗了,於是在各種折騰之下學會了手動安裝r包。

第二步需要找到自己在伺服器上安裝的r包的library庫的絕對路徑。

先進入r互動式命令列,然後使用命令install.packages("package_name",repos = null),這樣可以找到library路徑。

第三步在bash命令列下編譯安裝r包。

r cmd install -l /path/to/your/library  /path/to/your/downloaded/package

這樣就完成r包的手動安裝了。目前我個人覺得這種安裝方法是萬能的,但是有乙個最大的缺陷的,一旦你要安裝的r包存在依賴包,那麼還需要先安裝依賴包,才能安裝需要的r包。

source("")

bioclite("package_name")

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