集群LSF作業提交系統Bsub命令使用

2021-08-29 10:25:24 字數 1202 閱讀 8853

bsub,提交給lsf作業的命令。

1.命令格式:

bsub  [options]   command   [argument]

bsub   -pack  job_submission_file

2. 引數含義:

-q    選擇佇列

-i     指定輸入檔案  

-i      互動模式,此時終端不能輸入

-o     指定輸出檔案,作業提交後標準輸出的資訊會儲存到這個檔案中。

-e     指定輸出檔案,作業提交後標準錯誤輸出的資訊會儲存到這個檔案中。

-n     指定作業需要的cpu核

-j     作業的名字

3.命令:

bjobs :檢視系統的job

bsub:提交作業

bhist:檢視作業歷史

bkill: kill乙個作業

4.程式例項:

#!/bin/bash

#bsub -q smp (選擇佇列)

#bsub -o %j.out (結果輸出檔案,以作業號為檔名)

#bsub -o %j.err (錯誤輸出檔案,以作業號為檔名)

#bsub -a openmpi (編譯器)

#bsub -n 8 (計算核心的數量)

mpirun.lsf sander.mpi -o -i min_2ojn.in -o min_2ojn.out -p 2ojn.top -c 2ojn.crd

-r min_2ojn.rst -inf min_2ojn.inf

#!/bin/bash

#bsub -q smp

#bsub -n 8

#bsub -o %j.out

#bsub -e %j.err

#bsub -a intelmpi

mpirun.lsf ./並行可執行檔案

對於得到的job.sh檔案,要修改執行許可權,一般使用 chmod 777 job.sh

使用bsub命令進行提交作業:

bsub 

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