heffner e l , lorenz a j , jannink j l , et al. plant breeding with genomic selection: gain per unit time and cost[j]. crop science, 2010, 50(5):1681.基因型分型成本近年來顯著減低, 它可以代替mas(marker assisted selection), 而且使用範圍更廣.
這裡比較了mas和gs兩種方法, 在一定預算下玉公尺和冬小麥上進行育種測試, 結果表明gs相對於mas可以提高遺傳增益, 縮短育種週期.
dh: 雙單倍體
gca: 一般配合力
sca:特殊配合力
gebv: 基因組估計育種值
gs: 基因組選擇
gs-bp: 基因組選擇育種流程
ld: 連鎖不平衡
mas: 分子標記輔助選擇
mas-bp: 分子標記輔助選擇育種流程
tbv: 真實育種值
ypu: 小區產量
4. 玉公尺應用mas和gs的流程比較
兩種方法都是使用dh系進行, 從兩親本雜交變為f1, f1種植, 加倍, 變為雙單倍體的種子. 對種子進行測序(晶元)得到基因型資料. 第一年, 我們獲得4500個dh0系的種子.
使用mas-bp
使用gs-bp
相當於mas用時3年, 而gs用時1年.
5. 冬小麥應用mas和gs的流程比較
gs花費3年選擇親本,5年進行高階測試
mas劃分7年選擇親本, 7年進行高階測試
6. mas和gs成本比較
7. mas和gs在玉公尺和冬小麥遺傳進展的比較
遺傳力高時, 在玉公尺中的遺傳增益, gs是mas的3倍, 在小麥中是2倍.
低遺傳力時, 在玉公尺中的遺傳增益, gs是mas的2.5倍, 在小麥中是1.5倍.
常規的育種沒有mas的育種遺傳增益高, 可以推斷出gs的育種的遺傳增益要顯著高於常規育種.
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