Quorumpeps 群體感應資料庫簡介

2021-09-07 13:35:42 字數 1057 閱讀 1331

群體感應的定義:

細菌能自發產生、釋放一些特定的訊號分子,並能感知其濃度變化,調節微生物的群體行為, 這一調控系統稱為群體感應。細菌群體感應參與包括人類、動植物病原菌致病力在內的多種生物學功能的調節。

近年來的研究證明細菌之間存在資訊交流,許多細菌都能合成並釋放一種被稱為自誘導物質(autoinducer,ai)的訊號分子,胞外的ai濃度能隨細菌密度的增加而增加,達到乙個臨界濃度時,ai能啟動菌體中相關基因的表達,調控細菌的生物行為。如產生毒素、形成生物膜、產生抗生素、生成孢子、產生螢光等,以適應環境的變化,我們將這一現象稱為群體感應調節(quorum sensing.qs)。這一感應現象只有在細菌密度達到一定閾值後才會發生,所以也有人將這一現象稱為細胞密度依賴的基因表達(cell density dependent control of gene expression)

根據細菌合成的訊號分子和感應機制不同,qs系統基本可分為****性的型別:革蘭氏陰性細菌一般利用醯基高絲氨酸內酯( ahl) 類分子作為ai ,革蘭氏陽性細菌—般利用寡肽類分子(al p) 作為訊號因子,另外許多革蘭氏陰性和陽性細菌都可以產生一種ai - 2的訊號因子,一般認為ai - 2是種間細胞交流的通用訊號分子,另外最近研究發現,有些細菌利用兩種甚至三種不同訊號分子調節自身群體行為,這說明群體感應機制是極為複雜的

檢索介面如下:

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檢索的結果如下:

每個欄位的含義如下:

id : 資料庫中記錄的id號,每條記錄乙個唯一的id,從1開始

sequence: 序列名稱,可以在ncbi中檢索得到對應的序列資訊

molecular formula : 分子式

species origin : **的物種

receptor : 受體

reference : 對應的文獻的數量

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