菌群多樣性分析報告

2021-09-12 17:45:58 字數 602 閱讀 7267

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在開始實驗專案之前,明確實驗流程,一步一步獲取實驗結果,以視覺化工具展現結果,並加以生物學意義上的分析,獲取完整的分析報告。下面給出菌群多樣性分析報告中應包含的大致內容,並對實驗流程做出指導性的闡述。

1.專案背景與概況

簡單闡述所研究專案的國內外現狀,本專案的目的與意義。

2.材料與方法(material and methods)

2.1原始資料測定實驗流程

2.2資料分析流程

利用原始測序資料以及樣本的分組資訊進行一系列資料分析,流程如下。

(1)序列預處理和質量控制

(2)otu劃分與分類

劃分得到樣本的otus.獲取各otu的代表序列,通過各otu所包含的reads數目,建立otu_table;用於分類level鑑定和系統發育學分析。該分析過程可用一些視覺化工具進行分析描述.

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