華大基因股份公司總監金鑫介紹了華大基因，並**了與阿里雲的情緣，包括maxcompute等方面應用案例。一起來看下吧。
華大基因是中國最領先的基因科技公司，華大基因為消除人類病痛、經濟危機、國家災難、瀕危動物保護、縮小貧富差距等方面提供分子遺傳層面的技術支援。目前，世界上只有兩個國家的三個公司可以生產、量產臨床級別的基因測序儀，華大基因是中國的唯一一家。我們在基因的產權研發方面從2023年開始做了很多的工作。在2023年，我們與阿里雲有了初步的接觸，在2023年上線了我國第乙個基因雲計算平台。
我們與阿里雲合作是因為我們看到基因技術從過去的只在實驗室中逐漸進入到廣大群眾的生活場景當中，不管是在醫學健康方面、生殖健康方面、腫瘤防治方面、病原感染方面還是農業育種，以及與我們每個人息息相關的健康管理，基因技術已經取得越來越多的應用場景，在國產基因測序儀的助力之下，基因資料產生的體量也越來越龐大，遠遠的超出了原有的計算能力所能支援的範圍。
正是這樣的背景之下，在非常強勁的需求驅動下，我們與阿里雲開始了合作，使用了阿里雲計算儲存的多款產品，尤其包括批量計算、maxcompute等一些異構計算方式，使我們原先需要幾周甚至更長時間才能完成的計算任務在一兩天內得以解決。在我們現在進行的百萬人基因組專案中，阿里雲的maxcompute技術幫助我們大大加速了對於人群結構的分析速度的進展，相關的結果我們也在整理中。
每個人的基因資料為100g，傳統計算方式處理需要三到五天，使用maxcompute使得整個分析可以在一小時內完成，大大加速了資料吞吐速度和交付速度。另外，在對100萬人的基因資料進行遺傳結構分析時，我們需要把每乙個人與剩餘的所有人進行遺傳距離計算，這個計算量是巨大的，計算複雜度已經遠遠超出了傳統計算條件下硬體裝置所能承受的能力範圍，通過使用maxcompute，我們已經在這方面取得了技術突破，我們在幾小時內就可以把乙個人與百萬人中所有遺傳距離進行計算，這樣的例子我們還在不斷的開發中，相信maxcompute也會給我們帶來更多的驚喜。
在儲存方面，我們也使用了阿里的產品，每年我們會產生非常多的基因資料，明年我們計畫對10萬人進行基因組的基因測序和分析，我們將與阿里雲計算平台一起在2023年用國產測序儀完成計算、分析和交付。
華大基因BGI Online的雲計算實踐
本文正在參加 最佳上雲實踐 評選，來給我們投票吧 編號13 基因測序為生命科學領域帶來機遇，隨著測序技術的發展和測序成本的降低，基因測序在生物資訊與醫療健康等領域得到廣泛應用。但同時，基因測序行業也面臨著處理及分析海量資料的全新挑戰。傳統的硬碟已無法滿足大資料的儲存，而大資料處理和分析解讀工作存在複...
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