HiC資料預處理後一些輸出格式(整理中,歡迎補充)

2021-10-06 08:13:06 字數 631 閱讀 5520

juicer的輸出檔案:merged_nodups.txt

read1的flag,對應sam的第二列,flag

read1比對的contig,對應sam的第三列,rname

read1比對的contig的位置,對應sam的第四列,pos

read1排序後的位置編號

read2的flag,對應sam的第二列,flag

read2比對的contig,對應sam的第三列,rname

read2比對的contig的位置,對應sam的第四列,pos

read1排序後的位置編號

read1的比對得分,對應sam的第五列,mapq

read1的cigar,對應sam的第六列,cigar

read1的序列

read2的比對得分,對應sam的第五列,mapq

read2的cigar,對應sam的第六列,cigar

read2的序列

read1的id

read2的id

read所在鏈可以通過falg計算,我統計之後發現只有0和16兩個值(2048會被直接過濾掉),0表示'+',而16表示'-'。

hic-pro的輸出檔案*.allvalidpairs

C 一些輸出格式控制

1.輸出true false 而非 1 0 輸出新增 boolalpha cout default bool values true false nboolalpha bool value boolalpha 輸出true false 2.按照指定的基數輸出 浮點數不受影響 八進位制 oct 十進位...

通過預處理命令設計實數的輸出格式

題目 請設計輸出實數的格式,包括 1 一行輸出乙個實數 2 一行內輸出兩個實數 3 一行內輸出三個實數。實數用 6.2f 格式輸出 程式一 include define nl n 注意與 define nl putchar n 的區別與使用方法,詳見程式二 define pr printf 巨集定義...

資料預處理時的一些基本操作

1 刪除某一列 df.drop 列名,axis 1 刪除列 inplace true 對原dataframe進行操作 2 判斷哪一列有空值 df.isnull any 如果有空值 則該列返回true,否則返回false 3 刪除值含空的資料 df.dropna 引數how預設為any 如果該行資料有...