由於我之前已經在伺服器裡裝好了gromacs和namd，因此openmpi fftw等都已經裝好了。
假裝所有的依賴包都沒有安裝，那麼在root許可權下輸入下面的命令：
apt-get install gcc
apt-get install g++
apt-get install mpi-default-*
apt-get install libfftw3*
即可把這些包都安裝好。
直接安裝lammps
tar -xvf lammps-stable.tar.gz
cd lammps-3mar20/src/make/machines
把makefile.ubuntu複製到 src/make 目錄下：
cp makefile.ubuntu …/
cd …
可以看到此時 lammps-3mar20/src/make目錄下有下面三個makefile檔案：
makefile.mpi makefile.serial makefile.ubuntu
我的ubuntu伺服器不需要輸出，因此在目錄 lammps-3mar20/src/make 內的makefile.ubuntu 裡把 jpg 有關的行都注釋掉。
cd …/
到lammps-3mar20/src/目錄下執行
make package-status
檢視有哪些包是yes態和no態；yes表示安裝，no表示不安裝。用make yes-包名或make no-包名， 載入/取消你安裝的包。選擇自己必要的包就行了,特別注意，選擇了需要的包，也得跟自己的電腦支援情況對應。
我的選擇有：
make no-reax
make no-gpu
make no-meam
make no-user-smd
make yes-kspace
make yes-molecule
make yes-rigid
make yes-user-reaxc
make yes-user-misc
make yes-shock
make yes-manybody
make yes-class2
make yes-mc
make yes-user-meamc
再檢視是否yes了
make package-status
在目錄lammps-3mar20/src/下執行
make ubuntu
命令，等待安裝，經過漫長的安裝過程之後，螢幕提示生成 lmp_ubuntu ，即安裝好了。
此檔案在目錄lammps-3mar20/src 內。
並把lmp_ubuntu複製到目錄：/usr/local/bin 內
cp lmp_ubuntu /usr/local/bin
安裝完成後設定環境變數
sudo vim /etc/profile
#在檔案中加入如下內容
export path=/usr/local/bin:$path
#儲存關閉檔案後執行
source /etc/profile
那麼並行版的lammps就安裝好了，安裝目錄在/usr/local/bin
在其他目錄下可以直接輸入 lmp_ubuntu 的後續命令了。
which lmp_ubuntu
結果顯示：
/usr/local/bin/lmp_ubuntu
成功了。
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