用Python模糊匹配處理人工資料的匹配

2021-10-07 03:18:24 字數 435 閱讀 8938

生物資訊處理一些經過人工輸入的資料,往往有少量的錯誤。但是這些元資料往往要與結果資料統一分析,且非常之重要。資料量小,那就乙個乙個改吧,如果太多了,杯具了, 怎麼辦?

工作需要寫了乙個python小函式,用fuzzywuzzy模糊匹配技巧解決人工資料和標準資料的匹配問題。基本原理是先精確匹配,如果沒有,採用模糊匹配遍歷目標空間,選取打分最大的提交使用者檢查,最後輸出結果。

分享給大家,也許有用。

fuzzywuzzy: fuzzywuzzy 0.16.0

這裡用了fuzzy.ratio,大家也可以根據需要選其它的,參看文件。

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