ABIDE資料集預處理專案

2021-10-08 03:56:31 字數 1455 閱讀 2297

4 github專案**

專案**:

preprocessed connectomes project (pcp) 專案從autism brain imaging data exchange (abide)公眾發布和開放共享預處理神經影像資料。由國際神經影像資料共享倡議組織(indi)組成的聯盟是由16個國際影像站點協作組成,這些站點已聚集並公開共享了539名患有asd和573個典型對照者的神經影像資料。這1112個資料集由結構mri資料(smri)和靜止狀態功能mri資料(rs-fmri)以及大量的表型資訊組成。

abide專案**:

五個不同的團隊使用他們首選的工具對abide的資料進行了預處理。使用以下程式執行功能性預處理:

由於圍繞帶通濾波和全域性訊號回歸的爭議,對每個管線執行了四種不同的預處理策略:帶和不帶濾波以及帶和不帶全域性訊號校正的所有組合。為了將輸出之間的差異限制為僅進行預處理,cpac軟體計算了每個管道和策略的統計衍生物。使用三個不同的管道進行結構預處理和皮質測量的計算: ants, civet和freesurfer。

根據hipaa準則和1000個功能連線組專案/ indi協議,所有資料集都是匿名的,不包括受保護的健康資訊。

關於預處理靜息狀態功能磁共振成像資料的最佳方法尚無共識。我們使用四個不同的預處理管道對資料進行了預處理,而不是強制性說明並偏向於採用一種單一的處理策略,每種預處理管道都是使用管道開發人員選擇的引數和設定來實現的。

不同管道實現的預處理步驟非常相似。變化最大的是每個步驟所使用的特定演算法,其軟體實現以及所使用的引數。以下各節概述了不同的預處理步驟以及它們在管道中的變化方式。

每個流水線實現某種形式的擾變數回歸的1,2至乾淨混雜的變化,由於生理過程(心臟搏動和呼吸),頭部運動,和低頻掃瞄器漂移,從功能磁共振成像訊號。

每個管道用於計算四種不同的預處理策略:

對於包括全域性訊號校正的策略,全域性平均訊號包含在討厭變數回歸中。在有害變數回歸之後應用帶通濾波(0.01-0.1 hz)。

從功能到解剖和解剖到模板的轉換為每個資料集計算了從原始到模板的轉換(mni152)空間。使用兩步過程來計算解剖結構到模板的變換,該過程涉及(乙個或多個)線性變換,隨後使用非常高維的非線性變換對其進行細化。當將資料寫入模板空間時(通常在計算導數之後,除了niak之外),所有轉換都同時使用以避免多次插值。

資料集預處理 劃分測試資料集合

野子電競資料官網改版全新登場 在乙個資料集中隨機選出80 的記錄作為訓練資料集,訓練得到相應的數學模型之後,將剩餘的20 的記錄作為驗證,測試模型的準確性。原有資料集形式 1 1193 5 978300760 1 661 3 978302109 1 914 3 978301968 1 3408 4 ...

資料預處理

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資料預處理

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