CentOS7下安裝hdf5r包

2021-10-08 10:30:04 字數 1289 閱讀 4208

安裝hfd5r報錯

please ensure that at least version 1.8.13 is installed error: configuration failed for package 『hdf5r』

yum -y install hdf5-devel
安裝為1.8.12,版本不夠,所以需要自己手動安裝

確保解除安裝舊版本

yum remove  hdf5-devel
手動安裝hdf5
wget  #或以上版本

tar -zxvf hdf5-1.8.17.tar.gz

cd hdf5-1.8.17/

./configure --prefix=/usr/local/hdf5-1.8.17##根據自己路徑修改

make

make check

make

install

make check-install

vim ~/.bashrc

##新增行

export ld_preload=/usr/lib64/libhdf5.so.8:/usr/lib64/libhdf5_hl.so.8 ##根據自己的檔名改路徑和字尾

##儲存後

source ~/.bashrc

echo ld_library_path=

$:/usr/local/hdf5-1.8.17/lib >> ~/.renviron

#或echo

"dyn.load('/usr/local/hdf5-1.8.17/lib/libhdf5_hl.so.10')"

>> ~/.rprofile

for f in /usr/local/hdf5-1.8.17/bin/* ;

doln -s $f /usr/local/bin ;

done

echo /usr/local/hdf5-1.8.17/lib > /etc/ld.so.conf.d/hdf5.conf

開啟r
dyn.

load

('/usr/local/hdf5-1.8.17/lib/libhdf5_hl.so.10'

)##找到libhdf5_hl.so.10,寫正確路徑

install.

packages

("hdf5r"

)library

("hdf5r"

)

安裝成功

小白,有幾步不知道有沒有重複,反正都試了

參考:

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