perl程式執行查詢指定id的fasta序列

2021-10-08 13:21:09 字數 531 閱讀 7871

本程式用於查詢指定序列id的fasta序列,基本思路就是將需要查詢的fasta檔案序列id存入乙個雜湊,然後遍歷目標fasta檔案,進行查詢。

#!/usr/bin/perl

use strict;

use warnings;

my$target_ids;my

%id;

my$num

;open in1,

$ar**[0

]||die$!

;##目標id檔案

open out,

">$ar**[2]"

||die$!;

##輸出檔名稱

while()

=1;}

open in2,

$ar**[1

]||die$!

;##待查詢的fasta檔案

while()

)}else}}

close in1;

close in2;

close out;

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