西藥資料庫 DrugCentral介紹及使用方法

2021-10-10 02:13:22 字數 677 閱讀 1757

在網路藥理學研究中,通常需要查詢西藥的靶標等資訊。大家用drugbank資料庫比較多。這裡介紹乙個新的西藥資料庫drugcentral. 它的**是:

文末檢視

資料庫中藥物作用機制資訊來自若干專家注釋的資源:chembl資料庫、guide to pharmacology , kegg drug, 以及人工從文獻和藥物標籤提取。藥物功能資訊蒐集自 anatomical therapeutic chemical (atc) 藥物分類系統, the fda established pharmacologic class (epc) , medical subject headings (mesh),chemical entities of biological interest (chebi) ontology. 對2023年以前批准的藥物,適應症資訊來自omop 詞彙;2023年以後批准的藥物,適應症資訊來自藥物標籤並對應到snomed-ct概念.

資料庫包含的內容和它們之間的關係見下圖。

2023年公升級版加入了fda不良事件報告系統(faers)資訊,fda橙皮書資訊,l1000基因轉錄譜的距離/相似性矩陣和估計的質子化常數。

下面介紹drugcentral的使用方法。

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資料庫 資料庫索引

索引是儲存引擎用於快速找到記錄的一種資料結構。索引以檔案的形式儲存在磁碟中。索引可以包含乙個或多個列的值。儲存引擎查詢資料的時候,先在索引中找對應值,然後根據匹配的索引記錄找到對應的資料行。1.b tree索引 2.雜湊索引 myisam和innodb儲存引擎 只支援btree索引,也就是說預設使用...

資料庫 資料庫正規化

關聯式資料庫的設計規範。不同的規範要求被稱為不同的正規化,越高的正規化資料庫冗餘越小。減少資料庫中資料冗餘的過程 1 第一正規化 1nf 在關係模式r中,當且僅當所有屬性只包含原子值,即每個分量都是不可再分的資料項,則稱r滿足1nf。例如表所示的教師職稱情況關係就不滿足1nf。原因在於,該關係模式中...

資料庫 資料庫基礎

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