注釋資料庫介紹之GO KEGG資料庫

2021-10-11 21:38:34 字數 694 閱讀 9531

做過測序的小夥伴肯定都知道go、kegg資料庫,我們想要知道基因發揮什麼功能、參與什麼途徑,就一定要看基因功能注釋的結果,而go、kegg這兩個資料庫是基因功能注釋常用的資料庫,也是常常出現在測序文章中,但是你真的了解這兩個資料庫嗎?

go資料庫

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go資料庫的命名

go(gene ontology)是基因本體聯合會(gene onotology consortium)建立的資料庫。目的在於建立對基因和蛋白質功能進行限定和描述,可以適用於各個物種,並且隨著研究不斷深入而更新的語言詞彙標準。go是多種生物本體語言中的一種,提供了三層結構的系統定義方式,用於描述基因產物的功能。

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go資料庫的定義

gene ontology (go)為了能夠使對各種資料庫中基因產物的功能描述相一致,發展了具有**結構的標準語言(ontologies)。根據基因產物的相關分子功能,生物學途徑,細胞學組成而給予定義,無物種相關性。目前,go的定義法則已經在多個合作的資料庫中使用,使得這些資料庫在查詢時具有很高的一致性。例如,go可以被用來在小鼠基因組中查詢和訊號轉導相關的基因產物,也可以進一步找到各種生物的受體酪氨酸激酶。這種結構允許在各種水平新增對此基因產物特性的認識。

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資料庫約束注釋

增加check 約束 alter table staffinfo table name addconstraint chk position 約束名 check position 列名 in chairman manager staff 約束條件 增加外來鍵約束 alter table staffi...

資料庫物件(注釋)

定義 對錶本身或表中的每個字段新增一段解釋說明,使得初次接觸該錶的開發人員能盡快了解該錶。體現 1.表結構描述中 2.查詢結果某行資料縱向展示時 注釋列 建立注釋 comment on column tb name.col name is 注釋內容 修改注釋 comment on column tb...

資料庫之介紹篇 一

資料庫通常分為層次式資料庫 網路式資料庫和關係式資料庫三種。而不同的資料庫是按不同的資料結構來聯絡和組織的。而在當今的網際網路中,最常見的資料庫模型主要是兩種,即關係型資料庫和非關係型資料庫。當前在成熟應用且服務與各種系統的主力資料庫還是關係型資料庫。代表 oracle sql server mys...