大部分的都是使用的vmware的虛擬機器我也沒試，不過感覺應該會挺快的vmware虛擬機器安裝教程
直接查的教程：安裝ubuntu系統
另外乙個教程
這兩個都是安裝ubuntu的教程，具體哪個好用取決於哪個可以解決你的問題，你的疑問有時候有的教程是一筆帶過的，這就需要你一直查。嗯，學會自己查也很重要。
安裝vmware-tools（將linux與windows互聯–就是可以複製內容共同使用，或者是互傳檔案）時遇到的問題：autodock vina的具體安裝好像沒有用上面下的解壓包，直接在終端裡面下就可以了：這時候工作列的地方會有乙個光碟模樣的東西，點開可以，裡面有需要的壓縮包
1.客戶機作業系統已將 cd-rom 門鎖定問題（縮寫的）：給乙個教程解決我覺著挺好的，不需要命令啥的，直接以不同方式提取：提取教程
具體的安裝教程：
安裝教程
sudo apt install autodock-vina我下的是mgltools_x86_64linux2_1.5.6.tar.gz
注：1.中間查資料的時候遇到flash player沒法用：普通教程就可以了
2.其實關於壓縮的直接提取就可以了，其實也就是解壓。
任務一：提取…_.pocket.pdb檔案的x,y,z軸的最值，存到另外乙個檔案中在終端裡面直接輸入就可以看出效果，要是想處理大量的檔案，需要寫乙個指令碼，然後用迴圈即可。（一定要知道你現在所處的位置進行操作–也就是知道你現在的所處路徑）任務二：用mgltools將…_ligand.mol2檔案轉為.pdbqt格式
注：1.shell指令碼如何讀取乙個資料夾下所有的檔名
files=$(
ls$folder
)for file in $files
doecho
$file
done
看一篇文章把：變數與字串的連線知識點
#file是乙個迴圈變數： file_ligand.mol2是我想要訪問的檔案
filename="$file"
/"$_ligand.mol2"
#最後使用這個的形式：
$filename
命令：
/home/pfl/software/mgltools/mgltools_x86_64linux2_1.5.6/bin/python .
./prepare_ligand4.py -l 1a0q_ligand.mol2 -a bonds -u lps
1./home/pfl/software/mgltools/mgltools_x86_64linux2_1.5.6/bin/python
這是你的python的路徑
2.../prepare_ligand4.py
這個是你的prepare_ligand4.py包的路徑（我寫了乙個相對路徑）
3.1a0q_ligand.mol2
這個是mol2檔案
其他的直接用的老師給的
pbs作業排程系統的使用技巧 —>pbs
1.linux快捷鍵
非常感謝以上大佬們的教程
記錄一下自己的學習過程
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