python基礎 找基因

2021-10-14 07:56:26 字數 1169 閱讀 2750

仍然需要優化,總覺得轉了幾個彎。暫時性通過

總體思路是將一串基因,每一次從上面取一截下來,然後函式迭代解出來

def

find_gene

(genes)

:if genes.find(

'atg')!=

-1: index = genes.find(

'atg'

) start = genes[index+3:

]#截至到起始密碼子之後

number =

len(start)//3

#使用列表的手段,將字串三個三個拿出來

gene =

for i in

range

(number):3

*i:3

*i+3])

final =

['tag'

,'taa'

,'tga'

]#將終止密碼子儲存起來

final_index =

for x in final:

if x in gene:

)if final_index:

#如果存在終止密碼子繼續執行

first = gene[

:min

(final_index)

]#終止密碼子等價

print(''

.join(first)

)#取出第一段基因

second = gene[

min(final_index)+1

:]#取出其餘部分轉換為字串開始迭代

second =

''.join(second)

find_gene(second)

else

:#不存在的話就,走人

print

('error'

)genes =

input

('give me the genes:'

)if genes.find(

'atg')==

-1:#起始密碼子都不存在的情況

print

('error'

)else

: find_gene(genes)

在網上有人用genes.split(『atg』)分段,但其實

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