Linux MPI集群配置

參考文件：linux下mpi並行程式設計環境搭建配置

mpi是一種平行計算架構，mpich是mpi的一種實現，本集群使用虛擬機器安裝，作業系統是ubuntu14.04，使用三颱機器，使用者名稱都是ubuntu，機器名分別是ub0, ub1, ub2

$ tar -xzvf soft/mpich-3.0.4.tar

.gz$ cd mpich-3.0.4/$ ./configure --prefix=/usr/local/mpich
$ make && sudo make
install

安裝後加入環境變數到/etc/profile檔案，並執行source /etc/profile，追加內容到/etc/profile

path=$path:/usr/local/mpich/bin

manpath=$manpath:/usr/local/mpich/man
export path manpath

單節點測試

cp -r examples/ /usr/local/mpich

執行

mpirun -np 10 ./examples/cpi

輸出結果如下：

process 0 of 10

is on ub0
process 
9 of 10
is on ub0
process 
1 of 10
is on ub0
process 
4 of 10
is on ub0
process 
5 of 10
is on ub0
process 
7 of 10
is on ub0
process 
2 of 10
is on ub0
process 
3 of 10
is on ub0
process 
6 of 10
is on ub0
process 
8 of 10
is on ub0
3.1415926544231256, error is 0.0000000008333325
wall clock time = 0.020644

集群配置

複製編譯程式到其他機器上面，這樣就不用在其他機器上進行原始碼編譯mpich，節省了時間

scp -r mpich ub1:/usr/local/

scp -r mpich ub2:/usr/local/

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