reputer可注釋葉綠體重複序列，包括4種型別，forward（f）, reverse (r), complement (c), palindromic (p)。其中重複序列的4種型別如下所示
執行結束後，會得到如下頁面，其中interactive viewer 重複序列顯示，但是我們可以點選download就會得到最終注釋的檔案。
最終的重複序列檔案如下所示
# 235 -3 8 /var/bibiserv2/a
11 41 r 11 41 0 3.70e-03
13 51 c 13 148 -1 9.03e-03
15 37 r 15 41 -2 1.37e-02
15 149 r 15 149 -2 1.37e-02
10 150 r 10 150 0 1.48e-02
10 181 r 10 181 0 1.48e-02
14 145 r 14 150 -2 4.74e-02
16 47 p 16 153 -3 5.47e-02
...
下面每一列的分別為：
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注釋轉換C 注釋》
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