受限壁附近高分子鏈的構象統計

2022-07-30 20:00:18 字數 4730 閱讀 9446

無限大平面附件的柔性高分子鏈

如上圖所示,高分子鏈一端位於距離平面\(l\)處,另一端座標為\(z\),設高分子鏈鏈節大小\(b\),高分子鏈鏈長為\(n_c\),則高分子鏈構象配分函式為

\begin

\begin

g(l,z)=&\sqrt}\left (\exp\left [-\frac \right ] - \exp\left [-\frac \right ] \right )\\

=&\fracr_g}\left (\exp\left [-\frac \right ] - \exp\left [-\frac \right ] \right )

\end

\label

\end

其中,\(r_g=\sqrt}b\),為柔性鏈的迴轉半徑。

配分函式為

\begin

\begin

\mathcal z=&\int_0^\infty g(l,z)\mathrm dz\\

=&\fracr_g}\int_0^\infty \exp\left [-\frac \right ] \mathrm dz\\

&-\fracr_g}\int_0^\infty \exp\left [-\frac \right ] \mathrm dz \\

=&\frac}\int_^\infty \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt \quad \left (\mathrm \quad t=\frac\right )\\

&-\frac}\int_^\infty \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt \quad \left (\mathrm \quad t=\frac\right )\\

=&\frac}\int_^0 \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt + \frac}\int_0^\infty \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt \\

&- \left ( \frac}\int_0^\infty \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt -\frac}\int_0^ \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt \right )\\

=&\frac}\int_^0 \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt + \frac}\int_0^ \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt\\

=&\frac}\int_0^ \exp\left (-t^2\right ) \mathrm dt\\

=&\mathrm \left (\frac\right )

\end

\label

\end

上式用到了誤差函式:

\begin

\mathrm (x) = \frac} \int_0^x \exp(-t^2) \mathrm dt = \frac} \int_^0 \exp(-t^2) \mathrm dt

\label

\end

自由能為

\begin

\frac = -\ln \mathcal = -\ln \mathrm \left (\frac\right )= -\ln \mathrm \left (\sqrt}\frac\right )

\label

\end

無限大平面附近的柔線——硬棒雙嵌段高分子鏈

如上圖所示,硬棒——柔線(rod-coil)柔線一端位於距離受限壁\(l\)處,硬棒可以自由旋轉,並忽略硬棒與柔線的相互作用。設硬棒和柔線的鏈長分別為\(n_d\)和\(n_c\),兩嵌段庫恩長度相等,均為\(b\)。構象分布為:

\begin

\begin

g(l,z,\theta)=&\sqrt}\left (\exp\left [-\frac \right ] - \exp\left [-\frac \right ] \right )\\

&\frac\exp\left [ -u(z,\theta) \right ]\\

=&\frac\exp\left [ -u(z,\theta) \right ]g(l,z)

\end

\label

\end

其中\(\theta\)為硬棒與\(z\)軸夾角,硬棒與受限壁相互作用為

\begin

u(z,\theta)=

\begin

0,&\theta \lt \pi-\arccos}, or \quad z \ge n_d b \\\\

\infty, & \theta \ge \pi-\arccos} ,and \quad z \le n_d b

\end

\label

\end

配分函式為:

\begin

\begin

\mathcal z&=\int_0^\infty \mathrm dz g(l,z,\theta)\int_0^\pi \mathrm d\theta \frac\exp\left [ -u(z,\theta) \right ]\sin \theta \\\\

&=\int_0^ \mathrm dz g(l,z,\theta)\int_0^\pi \mathrm d\theta \frac\exp\left [ -u(z,\theta) \right ]\sin \theta + \int_^\infty \mathrm dz g(l,z)\\\\

&=\int_0^ \mathrm dz g(l,z) \frac + \int_^\infty \mathrm dz g(l,z)\\\\

&=\int_0^\infty \mathrm dz g(l,z)-\frac\int_0^ \mathrm dz g(l,z) +\frac\int_0^ z g(l,z) \mathrm dz \\\\

&=\mathrm \left (\sqrt}l\right )-\fraci_1+\fraci_2

\end

\label

\end

下面計算\(i_1\):

\begin

\begin

\int_0^ \mathrm dz g(l,z)= &\fracr_g}\int_0^ \mathrm dz \exp\left [-\frac \right ]\\

&-\fracr_g}\int_0^ \mathrm dz \exp\left [-\frac \right ] \\

=& \frac}\int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt \\

&-\frac}\int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt\\

=& \frac}\int_^0 e^\mathrm dt +\frac}\int_0^ e^\mathrm dt

\\&-\frac}\int_0^ e^\mathrm dt + \frac}\int_0^ e^\mathrm dt\\

=&\mathrm \left (\frac\right )+\frac\mathrm \left (\frac\right )-\frac\mathrm \left (\frac\right )

\end

\label

\end

下面計算\(i_2\):

\begin

\begin

\int_0^ zg(l,z) \mathrm dz = &\fracr_g}\int_0^ z\exp\left [-\frac \right ] \mathrm dz\\

&-\fracr_g}\int_0^ z\exp\left [-\frac \right ] \mathrm dz\\

=& \frac}\int_^ (2r_gt+l)\exp(-t^2)\mathrm dt \\

&-\frac}\int_^ (2r_gt-l)\exp(-t^2)\mathrm dt\\

=&\frac}\left \ \right )^2 \right ] - \exp\left [-\left ( \frac \right )^2 \right ]\right \}\\

&+\frac} \int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt \\

&-\frac}\left \ \right )^2 \right ] - \exp\left [-\left ( \frac \right )^2 \right ]\right \}\\

&+\frac} \int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt\\

=& \frac}\left \ \right )^2 \right ]-\exp\left [-\left ( \frac \right )^2 \right ]\right \}\\

&+\frac} \int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt\\

&+ \frac} \int_^ \exp(-t^2)\mathrm dt\\

=& \frac}\left \ \right )^2 \right ]-\exp\left [-\left ( \frac \right )^2 \right ]\right \} \\

&+\frac\mathrm \left (\frac\right )+\frac\mathrm \left (\frac\right )

\end

\label

\end

自由能為:

\begin

\frac(l,n_d,n_c)} = -\ln \left [ \mathrm \left (\sqrt}l\right )-\fraci_1+\fraci_2 \right ]

\label

\end

高分子高斯鏈

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