基因富集分析是分析基因表達資訊的一種方法，富集是指將基因按照先驗知識，也就是基因組注釋資訊進行分類。
訊號通路是指能將細胞外的分子訊號經細胞膜傳入細胞內發揮效應的一系列酶促反應通路。這些細胞外的分子訊號（稱為配體，ligand）包括激素、生長因子、細胞因子、神經遞質以及其它小分子化合物等。
富集性分析應用範圍非常廣，從disease ontology, gene ontology, kegg, 到reactome pathway等等。
go分析能夠縮小查詢基因的範圍
bingo : 查詢這條通路上的差異基因！！！
go分析和kegg分析 GO富集分析 KEGG
time 2017 10 8 author feng shengyu 一 安裝必須的r包 推薦使用的r版本3.2.2 必須要安裝的包 1 clusterprofilter source bioclite clusterprofilter 2 org.mm.eg.db org.hs.eg.db 對應需...
基因富集分析
diff gene.entrez檔案，是通過各種差異基因軟體找出來的差異基因的entrez id號列表，每乙個id號一行，幾百個差異基因就幾百行 上述 為差異基因的kegg pathway富集分析結果 id kegg 資料庫中通路唯一的編號資訊。description gene ontology功能...
如何優雅展示GO富集結果
不知道分析過轉錄組的小夥伴有沒有碰到過這樣的問題 轉錄組後續做go富集的時候，發現最前面的那些term其實對應的基因都差不多，如果選前幾個畫圖，可能說明的只是一件事。我一般是手動選，在足夠顯著的前提下，選擇幾個不一樣的term來畫圖 當然還得符合預期 今天就發現了乙個網頁工具，可以對 語義 相似的g...