# -*- coding: utf-8 -*-
"""created on sat jun 20 19:36:34 2015
@author: chaofn
"""import os
"""這個程式的目的是將linux下/ifs/home/fanchao/manesh_pdb目錄中程式設計客棧的所有檔案（一共有215個檔案）
批處理將pdb檔案生成dssp檔案
"""#listdir返回檔名的列表
fileline=os.listdir('/ifs/home/fanchao/manesh_pdb')
#遍歷整個列程式設計客棧表
for i in range(len(filelinxikimmuie)-1):
#將字串用變數表示
input_file='/ifs/h程式設計客棧ome/fanchao/manesh_pdb/'+fileline[i]
#先去掉檔名的字尾，然後形成字尾為dssp的檔名
out_file=fileline[i].sp程式設計客棧lit('.')[0]+'.dssp'
output_file='/ifs/home/fanchao/manesh_dssp/'+out_file
#注意：引數的傳遞（先是%s，然後是%變數名），多個變數的傳入要用元組表示，在元組前用%
os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))
本文標題: pthon批量處理將pdb檔案生成dssp檔案
本文位址:
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