fMRI資料處理

2022-10-08 21:30:20 字數 1508 閱讀 5906

產生的一系列檔案中:

(1)頭動矯正  其中fd_jenkinson最好

下面這個是很早以前用來排除被試的,現在不用了,現在都用meanfd排除

headmotion.tsv: 顯示最大或平均頭動,mean fd,...一般使用 mean fd後面做統計分析

(2)reonent fun和reonent t1用於質量控制,調整位置到前聯合(空間的原點)     自己可以打分

有的被試被掃的面積沒有覆蓋到全腦,用來檢驗蓋住的多少,

(4)t1 dicom to nifti:

dicom的結構像轉成nifti

(5)bet: 結構像和功能像配準之前去除頭皮干擾

具體步驟:先bet去除頭皮干擾,然後結構像去配準功能像,後再應用到之前未去頭皮的結構像,再去segment分割(帶著頭皮分割效果好,bet也有可能損傷)

(6)t1 coreg fun:結構像配到功能像空間

(7)segment:把大腦的結構像分割成灰質、白質和腦脊液,是老的segment不用

用new segment+dartel:  36min

segment生成的結果:

(8)nuisance covariates regression:去除雜訊

polynomial trend:1 去除線性漂移

head motion model: 用friston 24 做頭動矯正

(9)normalize 空間配準

意義:將很多被試者的大腦配到乙個標準的模板上面,才能對相同的東西進行比較,如pcc

方法:1.epi模板 2.t1先對t1分割成白質灰質腦脊液,再用到功能影象上去 3.dartel:用的最多

45min dartel:基於分割結果,基於100個被試的group  ,,再把這個模板配到mni空間    費時。。

smooth:提高配準效果    注:計算reho、degree前不要用smooth!

default mask:基於腦內的體素進行

至此,所有的預處理步驟選擇完畢!!!  (只進行預處理的話,下面所有的一切全都不用選了)

資料分析:

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