易生信Linux培訓

2021-08-19 14:08:07 字數 1419 閱讀 8909

《生信寶典》和《巨集基因組》聯合舉辦的生物資訊系列9天實戰班,歷時5個月,已經順利完成了4期,包括轉錄組分析(高通量測序分析的基礎課),r語言/cytoscape繪圖(資料視覺化是解釋資料不可缺少的一部分),python程式設計(每個人都應該會一門程式語言),微生物組擴增子測序分析(當前最火的領域之一)。

linux課程是我們最早應該開的課程,但考慮到兩點:

只學習linux,與真正去處理手頭的資料還有一些差距。相當於只打好了地基,但看不到房子的樣子,會有一些失落感。考慮到市面上3-4天的課程都可以囊括很多內容,而我們這種致力於精細細分的方式,粗看上去會給人不夠有吸引力的感覺。(不過我們一直認為這是符合學習規律的,專一而博它。與其貪多嚼不爛,不如學多少,會多少。學通乙個,每個課程都可以融匯貫通到其它課程的應用。)

綜合以上兩個原因,我們前幾期並沒有開linux的課程,也沒有這個打算。

但後來在培訓過程中,在我們自己的討論中,在於各位參加課程的朋友的交流中,我們意識到還是有必要開始這一基礎課。

我們前面開過的課程都是零基礎課,致力於服務於零基礎的朋友們。轉錄組和微生物擴增子組分析會用到linuxr命令,我們都安排了單獨的課時進行必要的介紹,並每2-3人配備一位助教進行實戰輔導。經過9天學習,都可以理解整個分析內容,走下整個分析流程,獲得需要的結果和視覺化圖表,並能做一些融匯貫通。

但是基礎好的朋友,可以更快地吸收學習內容,並拓展到自己的應用案例。用自己的資料,把課程教授的分析方法,轉變為自己的分析方法,拓展出更多地應用,這樣得到的效果其意義是很大的。

相反基礎薄弱些的朋友,就需要一些時間在基礎內容上。在自己的不斷地嘗試和老師們的幫助下,可以領會整個理論內容和實戰流程。但實戰的細節的變通性和自如性不免不足,需要後期繼續花一些時間去鞏固、學習、拓展。

另外乙個原因,自己出錢買的東西,都是比較珍惜。我們的課程安排比較緊湊、學習壓力比較大,畢竟一門分析壓縮到幾天去學通,是很大的工作量。有自己的金錢付出,在興趣和必需完成的任務的基礎之上,又多了一層約束。我們也發現,學習效果、投入時間都是跟金錢付出成正比的。(當然,我們收費也有為自己考慮的地方,好的師資、培訓可持續性、場地、飲食、紀念品都需要費用維持。)

所以,我們覺得開啟linux課程是必要的,也希望有一樣見解、想徹底學會生信分析的朋友加入。我們不只可以提供上述的合適的學習環境,還有我們經驗豐富的老師和精心製作的教案,一定讓您不虛此行。

前期課程相關的推文列於下,方便查閱。

生信基礎(二) 生信學習資料

原創 hxj7 上次談到生信人員需要熟練掌握一些程式語言,還講了perl和python的選擇問題。那麼,如果已經選定了一門程式語言,到底該如何學習它呢?今天的我們可以通過mooc跟著名師學習或者上知乎提問,幸運的話還能得到大牛指點。不過,在我剛接觸程式設計的時候,mooc和知乎都還未興起,所以我都是...

易生信 擴增子教程02 真菌引物選擇

距離上次 生信寶典 聯合 巨集基因組 組織的擴增子分析線下培訓結束己經有三個多月了。為方便廣大讀者的學習,現在開始陸續分享上次培訓的內部資料 理論課程課件。希望對想自學分析的朋友起到一定幫助作用。首先講一下真菌的定義,真菌通常指的是真菌界的生物,是一類單細胞或多細胞異養真核微生物,無光合色素,細胞壁...

為易信正名

平時看到網民因意見不合而對罵,我覺得他們不道德。但是,今天看到說易信 偽需求 的,我還是把作者 注意,不包含他的家人 問候了個遍。我才知道以前之所以不理解為什麼罵的那麼慘絕人寰,原來其中有冤屈。非要顛倒黑白,豈能不被罵。這不是自相矛盾嗎?對於簡訊包,說實話400條簡訊很容易就發完了,易信能實現跨網發...