生信轉崗心得

2022-08-24 15:45:07 字數 2466 閱讀 8322

應健明的邀請,我也寫一篇關於轉行做生物資訊的心得,本來以為很輕鬆就可以寫出來的,但是發現並不那麼好寫。如果放在去年剛轉崗之時,我想應該更順手,那時感觸良多且深刻。不過我雖是個健忘的人,但是還清醒地記得去年7月份通過公司的轉崗答辯之時,心情無比的愉快與美麗,覺得終於從一名生信愛好者成為一名正規軍。之前為了轉崗,經常在業餘時間學習程式設計和生信的知識,有時甚至在不是很忙的工作時間也學,但是由於揹著生化工程師的身份,所以總感覺自己是地下黨。答辯通過後,在公司終於可以名正言順地做生信的工作了,地下黨的身份合法化了,瞬間感覺神清氣爽了。很開心的另外乙個原因就是自己以後可以有更多的時間做生信、學生信了,比以前只是業餘來學習應該會進步更快。

做生物資訊的人,我相信很多都是半路出家的,但是猜測很多都是在讀研的時候因課題需要才轉做生信的,但是像我這樣在公司裡跳過去的應該不多(我沒有統計,只是感覺),或者至少比在學校裡轉起來更困難些,因為在公司不比學校,公司需要工作效益,所以很難接受乙個沒有任何生信經驗的人在這個崗位上,何況我在這個公司的生化研發崗位做了近兩年的時間。不過感恩的是,我們公司真的很nice,當我提出轉崗需求的時候,我的頂頭上司——當時的化學部總監——ta非常支援我,認為我應該追求自己想做的東西,只要我思考清楚,ta就會支援我。我當時非常感動,要知道這是從ta的手下撤走呀。不過我提出轉崗也是尋找合適的機會才說的。記得當時2023年12月底,我們公司有乙個秘密專案剛剛結束,而我就在這個專案中負責一塊任務,所以一旦這個專案結束,意味著我們這些專案的人面臨調整,同時調整期我有會閒一些,所以本著卡空檔,不添亂的的想法,趕緊和我的總監正式提轉崗的需求,所以總監也非常熱心的答應幫助我。此外早前我也和上司通過氣,也就是2023年9月份,有一次和上司在路上,ta問我後面有什麼規劃沒有?我當時就透露了想轉做生信的想法,但是沒有表現出很急切,因為這個時候公司的秘密專案正式啟動,正是需要人手的時候,而且大家每天都很忙,所以我也僅僅是透了個風,這就是為什麼當我12月底正式提出轉崗時,上司第一反應不是詫異,而是贊同和支援,覺得我之前說說而已的想法居然要付出行動了。 正式提出轉崗後,總監立馬幫我和老闆申請,老闆也表示很理解與支援,所以後來我就進入差不多6個月的考察期,這期間每天正式工作還是生化的內容,但是逐漸減少生化內容並嘗試給我一些生信相關的工作,相當於是乙個過渡期吧,我抓住這個過渡期,每天大量學習、提公升程式設計能力,也跟著健明的《生信程式設計直播題》學了不少入門知識。最後寫了乙個大約6-700行的nipt分析程式,快速地提高了我python的程式設計能力,並最終以這個專案為轉崗答辯的題目。

除了當時的上司和老闆讓我感激之外,讓我最感謝的是公司的生信組的組長——我現在的上司。他這個人太nice了,性格隨和又樂於助人。當我2023年7月和他提出想做生信的時候,他毫不猶豫的表示歡迎。雖然當時只是在上班路上碰到後走在一起隨意地聊,但是我隨後又非常認真的詢問 申請轉生信崗是否可行時,他開始認真地幫助我,並給我一些小專案,讓我練手並熟悉生信工作內容,同時時常告訴我生信小組的人手情況,對新增人手的需求的緊迫性等等,讓我抓住恰當時機申請轉崗。這樣我對生信小組的情況比較了解,也知道生信小組確實需要人手,最後提出申請就非常順應公司狀況。此外在我的過渡期,有一次公司組織旅遊,我和組長住在乙個房間裡,我給他看我寫的**,他真一行一行的給我看,然後分析如何讓我順利的被公司承認我生信工程師的身份(當時公司雖然同意我轉做生信,但是編制以及工作內容都還是生化,而且公司沒有這個先例,所以沒有人知道該如何處理我這個轉崗案件),最後我們經過討論認為可以將nipt作為練手的專案,並將它的結果作為一次報告,做一次轉崗答辯,以正式證明我的程式設計能力、專案完成能力等。最後我確實是通過這種模式,才正式成為一枚生信猿。後來這種模式也被公司定為內部轉崗的標準模式。現在我每天的工作夥伴就是這位思維敏捷,性格開朗隨和的生信組組長,我每天的工作非常愉快,加上又做著自己喜歡的工作內容。

說了這麼多轉行做生信經過,其實我最想說的是轉做生信的動機。我是溼實驗出身,正如上文提到每天和生化試劑打交道。我轉做生信時很多當時的化學同事們問我「是討厭做實驗才轉行的?「 我說「並不是」。我之所以決定轉做生信,是結合自身的性格、愛好,決定了真的要從事生物研究的工作,並判斷利用計算機、資訊理論來處理生物問題一定是未來的方向。所以我的聚焦點依然是生物,只不過是手段有點改變而已。也正是這樣的定位,所以絕不會將生信作為進入it、其它行業的資料分析等等的跳板。而且必要的時候,溼實驗也是可以重拾的,一切要看以後的接觸的課題需要。而且幾乎所有的幹實驗的資料都**於溼實驗,所以乾濕實驗對解決生物問題都是非常重要的。最近通過乾濕結合的方法來解決生物問題越來越流行,這種文章也越來越多,尤其是那些比較巨集大的課題更是如此。

生信這個行當,要求可高可低,低的只是應用幾個軟體跑幾個流程都可以自稱生信工程師(感覺在說自己),高的........我還不是這個層次的,不瞎掰掰了,反正這深度夠我探索一輩子的,不用擔心什麼碰到技術天花板了。方向也真是千差萬別,有做基礎工程的,給生信分析軟體庫添磚加瓦;也有應用這些軟體的,來解決各種實際生物問題。所以有些人重程式設計,弱生物知識;有些人重生物知識,弱程式設計。我生物溼實驗背景出身,預計將是第二類生信猿。但是無論哪種猿,要想在自己方向做深,唯有統計學與演算法思想是不可或缺的。統計學與演算法思想將決定在生信路走多深。我也深知自己統計學知識薄弱,定當加強這方面的知識。

以上是我轉崗做生信的真實經歷與動機,並夾雜了少許對生信得理解。夜已深,要睡了,作為生信猿小菜鳥,明天繼續搬磚碼碼。。。。。。

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