r與python差異比較大的乙個地方就是，python的機器學習演算法集中程度比較高，比如sklearn，就整合了很多的演算法，而r語言更多時候需要乙個包乙個包去了解，比較費時費力，對於python轉過來的朋友非常不友好，抽空整理了工作中常用的r包如下：
常用檢驗函式：
基本上分布中常見的都羅列了：
常用作圖函式包：
ggplot2：萬能，基本上excel能畫的圖它都能畫
rattle：fancyrpartplot函式，決策樹畫圖函式
基礎包函式：barplot、pie、dotchart、hist、densityplot、boxplot、contour等等
正態檢驗：qqplot、qqline、qqnorm
連續分類回歸模型：
stats包 lm函式，實現多元線性回歸；glm函式，實現廣義線性回歸；nls函式，實現非線性最小二乘回歸；knn函式，k最近鄰演算法
rpart包 rpart函式，基於cart演算法的分類回歸樹模型
randomforest包 randomforest函式，基於rpart演算法的整合演算法
e1071包 svm函式，支援向量機演算法
kernlab包 ksvm函式，基於核函式的支援向量機
nnet包 nnet函式，單隱藏層的神經網路演算法
neuralnet包 neuralnet函式，多隱藏層多節點的神經網路演算法
rsnns包 mlp函式，多層感知器神經網路；rbf函式，基於徑向基函式的神經網路
離散分類回歸模型：
stats包 glm函式，實現logistic回歸，選擇logit連線函式
kknn包 kknn函式，加權的k最近鄰演算法
rpart包 rpart函式，基於cart演算法的分類回歸樹模型
adabag包bagging函式，基於rpart演算法的整合演算法；boosting函式，基於rpart演算法的整合演算法
party包ctree函式，條件分類樹演算法
rweka包oner函式，一維的學習規則演算法；jpip函式，多維的學習規則演算法；j48函式，基於c4.5演算法的決策樹
c50包c5.0函式，基於c5.0演算法的決策樹
e1071包*****bayes函式，貝葉斯分類器演算法
klar包*****bayes函式，貝葉斯分類器算分
mass包lda函式，線性判別分析；qda函式，二次判別分析
聚類：nbclust包nbclust函式可以確定應該聚為幾類
stats包kmeans函式，k均值聚類演算法；hclust函式，層次聚類演算法
cluster包pam函式，k中心點聚類演算法
fpc包dbscan函式，密度聚類演算法；kmeansruns函式，相比於kmeans函式更加穩定，而且還可以估計聚為幾類；pamk函式，相比於pam函式，可以給出參考的聚類個數
mclust包mclust函式，期望最大（em）演算法
關聯規則：arules包apriori函式
apriori關聯規則演算法
recommenderlab協調過濾
drm：重複關聯
eclat演算法： 採用等價類，rst深度搜尋和集合的交集： eclat
降維演算法：
psych包prcomp函式、factanal函式
時序分析：
ts時序構建函式
timsac包時序分析
holtwinter包時序分析
decomp、tsr、stl成分分解
zoo 時間序列資料的預處理
統計及預處理：
常用的包 base r, nlme
aov, anova 方差分析
density 密度分析
t.test, prop.test, anova, aov:假設檢驗
rootsolve非線性求根
reshape2資料預處理
plyr及dplyr資料預處理大殺器
最後剩下常用的就是讀入和寫出了：
rodbc 連線odbc資料庫介面
jsonlite 讀寫json檔案
yaml 讀寫yaml檔案
rmakdown寫文件
knitr自動文件生成
一般業務中使用比較多的就是上面這些了，當然r裡面有很多冷門的包，也很好用滴~
r語言安裝r包
cran，bioconductor還有github。bioconductor一般都是生物資訊方面的r包。github是 的託管平台，很多軟體，多種語言的程式包也都在這裡發布。install.packages dyplr 注意 更改映象 options repos c cran options bio...
R語言常用演算法包
1 聚類常用的包 fpc，cluster，pvclust，mclust 基於劃分的方法 kmeans,pam,pamk,clara 基於層次的方法 hclust,pvclust,agnes,diana 基於模型的方法 mclust 基於密度的方法 dbscan 基於畫圖的方法 plotcluster...
包r語言 R語言入門之R包的安裝
install.packages metafor 即可順利安裝該r包。install.packages biocmanager library biocmanager install edger 3 接下來便是安裝源自github 的r包了，它的步驟和安裝源自bioconductor的r包類似，需要...