記錄 DeepLesion 資料集分析

2021-10-04 22:22:24 字數 1080 閱讀 7782

deeplesion:最大開源臨床醫療影象資料集

每個切片被命名為「__/.png」

在3dce演算法裡找到窗寬的設定為[-1024, 3071]

影象以無符號16位儲存,要得到原始的 hounsfield unit (hu) 值,需要從畫素強度中減去32768.

注釋檔案分析:

在 dl info.csv,每一行都是深部病變的資訊。列的意義是

檔名。請用/或\替換最後的下劃線,以指示子資料夾

患者指數從1開始

每個患者的研究指標從1開始。每個患者有126個研究。

系列id

包含病變注釋的關鍵切片的切片指數,從1開始

8d向量,病變兩個直徑的影象座標。[x, y, x, y, x, y, x, y]。 前4個座標是長軸。請參閱我們的**及其補充材料作進一步說明

4d向量,病變的邊界盒[x, y, x, y]從直徑估計,見我們的**。

二維向里,長軸和短軸的長度。單位是畫素

病灶中心的相對身體位置。唑座標由自監督體部回歸器進行**。詳見我們的**。這些座標是近似值,僅供參考

病變的型別。1~8型分別為骨、腹、縱膈、肝、肺、腎、軟組織、骨盆。詳見我們的**。病變型別有粗略定義,僅供叄考。只有ⅶa和測試集中的病變被標註為-1

根據手動檢查,如果該病灶的注釋可能有雜訊,則將該字段設定為1.到目前為止,我們在32,735條注釋中找到了35條

片範圍。這個資料集中提供了與鍵片相鄰的上下文片。如第乙個病灶,關鍵切片為109,切片範圍為103-115,即提供103-115片時於大多數病變,我們在關鍵切片上下分別提供3mm的額外切片,除非病變的長軸大於這個厚度(然後我們提供更多),或者達到體積的開始或結束

x軸、軸和的間距(每畫素公釐)。第三個值是片間隔,即兩個片之間的物理距離

影象的大小

hounsfield單元中從原始dcom件中提取的視窗(最小-最大)

病人性別。f代表女性,m代表男性

病人的年齡

官方隨機生成的患者級資料分割,訓練=1,驗證=2,則試=3

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