一 、下面是一些自己之前遇到的可以用python處理的生物學問題，僅供參考。
1、fasta和fastq格式之前的互相轉化
2、根據基因id從fasta檔案中提取序列序列
3、比對後的fasta格式轉化為phylip格式
4、提取四倍兼併位點
5、根據基因名字從gtf或者gff檔案中提取基因id
二、可以模仿一些常用的軟體的部分功能，去寫能夠實現相同功能的python指令碼。
1、seqkit是乙個對核酸或者蛋白序列進行處理的軟體，比如取反向互補序列、序列資訊統計、提取部分序列、檔案切割等等。
2、csvtk是乙個對csv檔案進行處理的軟體，附帶了很多實用功能。
3、bedtools對bed檔案進行處理，取交集和並集等。可以模仿這些軟體的功能自己去寫python指令碼實現相同的功能。
三、如果題主是生物資訊領域的話，推薦乙個**，裡面有可以通過程式設計解決的各種小問題。
roaslind這個**上面有上百個生物資訊學方面的問題，每個問題都可以用python去解決，並且以背景知識和案例以及練習題的形式展現，非常適合新手進行程式設計練習。
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