生物資訊的工具和資料庫太多，但有一些基礎的工具是必須精通的，甚至需要經常翻閱尋找靈感。
ucsc genome browser - 基因組的視覺化
omim - online mendelian inheritance in man - 研究疾病必備
單細胞資料庫彙總
遺傳資料庫
表觀資料庫
蛋白資料庫: uniprot, pdb, pfam, cath, scop2
代謝物資料庫
待整理：
genemania - gene network, 分析碰到瓶頸了就去裡面找找證據。
webgestalt - 無需程式設計，網路版的go、kegg和gsea分析工具
tcga
gtex
geoencode
sragnomad
archs4
clinvar
noncode
gokegg
dbsnp
string
ncbi
gwasdb
omictools - 彙總資料庫 收費了
我的final model需要整合這些資料庫！！！
長期收集。。。
生物資訊領域常用軟體工具及資料庫
1.psi blast psi balst是一種更加高靈敏的blastp程式，對於發現遠親物種的相似蛋白或某個蛋白家族的新成員非常有效.多用於生成蛋白質的多序列比對 msa 和pssm 特異性位置打分矩陣 相關指令和生成pssm檔案的 參考 2.clustal clustal可以用來發現特徵序列，進...
生物資訊領域常用軟體工具及資料庫
常用工具 psi blast psi balst是一種更加高靈敏的blastp程式，對於發現遠親物種的相似蛋白或某個蛋白家族的新成員非常有效.多用於生成蛋白質的多序列比對 msa 和pssm 特異性位置打分矩陣 相關指令和生成pssm檔案的 參考 2.clustal clustal可以用來發現特徵序...
資料庫和資料庫物件
系統資料庫是指安裝完mysql伺服器後，會附帶的一些資料庫，系統資料庫會記錄一些必需的資訊，使用者不能直接修改這些系統資料庫。各個系統資料庫的作用如下 information schema 主要儲存系統中的一些資料庫物件資訊，如使用者表資訊 列資訊 許可權資訊 字符集資訊和分割槽資訊等。perfor...