小RNA的測序技術路線以及分析流程

2021-06-23 09:19:02 字數 615 閱讀 7164

小rna(smallrna)是生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。illumina gaiix 能夠對樣品中的全部small rna 進行深度測序,達到定性定量的研究目的。每個樣品可得到3 million 以上的small rna 測序序列。通過大量的平行測序,可以發掘、鑑定並定量出任何物種全基因組水平的小rna 圖譜、新mirna 分子的挖掘、靶基因的**和鑑定和樣品間差異表達分析等科學應用。

在下機資料中分好資料後,就要開展rawdata—>cleandata的步驟。

1) 資料產出統計 

2) 去除低質量、汙染及接頭後的序列長度分布統計; 

3) 不同樣本間的序列情況統計; 

4) 與參考序列比對情況統計(需甲方提供參考序列資訊); 

5) 與已發布mirna資料庫的比對統計; 

6) 與已發布rrna資料庫的比對統計; 

7) 重複序列注釋統計; 

8) 與mrna、exon、intron的相關度統計; 

9) 小rna注釋統計; 

10) 新的mirna**; 

11) 不同樣本間的差異統計分析; 

12) 靶基因**;

——待續

技術人員的晉公升路線

曾經面試過一些開發人員,發現他們不少人的想法是以後成為乙個經理,即使現在申請的是開發者的職位。而網路,報刊上也不乏這樣的言辭,軟體開發者,超過三十歲,如果公升不了官,就應該轉行了。我想,每個人都會針對現實,而選擇讓自己利益最大化的路線。所以,如果有那麼多的技術人員把成為管理人員作為職業規劃的目標,一...

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博文源址 博文內容如下 曾經面試過一些開發人員,發現他們不少人的想法是以後成為乙個經理,即使現在申請的是開發者的職位。而網路,報刊上也不乏這樣的言辭,軟體開發者,超過三十歲,如果公升不了官,就應該轉行了。我想,每個人都會針對現實,而選擇讓自己利益最大化的路線。所以,如果有那麼多的技術人員把成為管理人...

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