1、mol檔案追加到檢索庫
sdf
2、生成索引檔案fs
babel default1.sdf -ofs
3、精確檢索
smiles;inchi;
兩個格式結果等同，但smiles效率應該略高，採用的索引。
smiles:
babel search.mol -osmi
obabel default1.fs -o out.svg -s c1c(ccc(c1)[n+](=o)[o-])n exact
3個結果。
ex:babel "g:\default1\default1.sdf" -s "g:\default1\search.mol exact" -o out.svg
32個結果
，非精確，應該屬於高度相似匹配了。
inchi
babel search.mol -oinchi
babel default1.sdf
--filter \"
inchi
\" -ofpt
結果3個；
4、模糊檢索
babel default1.fs -s search.mol -at 0.7 -ofpt
at >1,取匹配得前幾項；
obabel default1.fs -o out.svg -s search.mol -at 4
at <1 ,取相似度以內的資料；
obabel default1.fs -o out.svg -s search.mol -at 0.8
5、子結構檢索
smiles
生成smi庫
babel default1.sdf -o default1.smi
檢索項轉化成smi
babel search.mol -osmi
檢索：obgrep -n "c1c(ccc(c1)[n+](=o)[o-])n" default1.smi
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