單細胞測序技術及應用進展

2021-08-09 18:22:56 字數 669 閱讀 4796

發表於: 基因組學與應用生物學,2015 年,第34 卷,第5 期,第902-908 頁

本文講了什麼?

細胞是生命的單位,然而大多數的人類基因組、癌症或其它研究仍然是通過從多個細胞中抽提dna 來進行測序,這忽略了細胞間的差異對於控制基因表達、細胞行為的影響,實驗結果往往表示的是細胞群體中訊號表達的均值,或者只代表其中在數量上佔優勢的細胞資訊,單個細胞獨有的細胞特性往往被忽略

解決方法

單細胞測序技術:

1.單細胞分離技術 (梯度稀釋法、顯微操作技術、螢光啟用細胞分選、微流控技術、雷射捕獲顯微切割):將目的細胞的從樣本中分離出。

2.單細胞全基因組擴增技術(基於熱迴圈以pcr 為基礎的全基因組擴增技術):將單個細胞溶解得到微量基因組dna進行高效地擴增,獲得高覆蓋度的單細胞

3.單細胞轉錄組擴增技術

目前單細胞技術存在問題

單細胞測序技術已經在腫瘤、發育生物學、神經科學、微生物等領域取得了豐富的成果。但目前該技術還存在一些問題;例如擴增存在偏倚性,非特異性擴增,建庫過程中存在汙染,檢測靈敏度不高,技術噪音高,操作失誤率高,重複性差、除mrna 以外的非編碼rna 難以檢測等。

且目前很少有專門針對單細胞測序資料分析的軟體和工具。

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