生物資訊通識課培訓

2021-09-01 14:21:42 字數 3294 閱讀 2054

作為對系列課程的補充,我們這次推出生物資訊通識課,包含常見組學技術的原理、應用和概念,r語言基礎,windows下使用linux命令快速提取資料和準備繪圖所需的檔案,常見組學圖形的解讀和繪製等,希望能為實驗生物學家了解生信和生信初學者提供乙個快速通道。

課程涉及主要內容如下:

編號主題

簡介11

生物資訊是什麼

能解決哪些問題,有哪些應用

12高通量技術概述

高通量測序應用的種類、概念、原理和用途介紹

13不同代次高通量測序技術

原理和優缺點

14組學和生物調控

案例解析

15擴增子和巨集基因組

基本概念和應用

16擴增子和巨集基因組

基本分析思路和圖表解讀

17常見資料庫使用介紹

多組學分析

21繪製mirna、基因、轉錄因子調控網路,菌群共存

公共資料庫獲取資料轉換格式,文獻挖掘

22kegg/reactome/go通路圖表達屬性視覺化

cytoscape,模式和非模式生物

23r語言基礎知識

資料讀取轉換

24r語言繪製常見圖形

見圖25

r語言繪製常見圖形

見圖26

繪製常見圖形和排版

可自己提需求

27分組、時間序列和數量性狀gsea

原理、操作和結果解讀

31linux基礎操作

常用命令解析,windows下操作

32linux軟體安裝

伺服器操作

33sed,awk操作

id轉換、檔案格式轉換

34linux命令練習

準備常見繪圖所需檔案

35wgcna基因共表達分析

表型關聯

36考試、圓桌論壇

自評學習效果、知識點回顧

41答疑-線上

答疑、考試內容串講

生物資訊是什麼,能解決哪些問題,有哪些應用

高通量測序有哪些型別和應用,smrna-seq,rna-seq, gro-seq, chip-seq, atac-seq, hi-c,scrna-seq, chia-pet, faire-seq, ribo-seq, chirp, cage-seq, clip-seq等等很多為解決特定問題而生的技術。

不同代次高通量測序技術的原理和優缺點

從細胞和dna結構闡釋生信在解析生物分子調控中的應用

擴增子和巨集基因組研究基本概念

擴增子和巨集基因組研究基本分析思路

擴增子和巨集基因組研究圖示解讀

微生物物種和功能組成cns文章套路解讀

利用常見資料庫挖掘基因的功能、表達模式和互作蛋白

cytoscape繪製網路圖

cytoscape繪製kegg/reactome通路圖並進行表達屬性視覺化

cytoscape繪製轉錄調控網路和蛋白蛋白互作網路

cytoscape進行go富集分析和視覺化

cytoscape進行文獻挖掘,探索基因功能

gsea本地軟體使用和結果解讀

其它軟體後續補充

文章發表圖的修改和排版

r語言資料處理和繪圖入門

生信軟體安裝基本概念和操作

生信linux基礎學習

在windows下如何利用簡單命令轉換檔案格式,提取序列,id匹配,為常用軟體提供資料輸入格式等

生信分析軟體舉例和適用範圍介紹

當然,以上列出的也只是一部分內容,更多的還希望各位朋友踴躍提出,定製專屬課程。

(如果基礎薄弱,報名付款成功後,可免費領取基礎程式課,做好準備工作, 讓程式成為我們的得力工具而不是學習新知識的絆腳石。)

十餘名中國科學院、清華、北大博士(含在讀),輪值講師和助教,輔助學員學習和矯正培訓過程中不足的點。

本課程以講解流程和實際操作為主,採用獨創四段式教學,封裝好的**全部分享,隨處可用:

北京市西城區鼓樓明德大廈 (北京市舊鼓樓大街47號院2號樓2010)。

截止 2018-12-8 4199 元/人

名額有限,每次課程報名滿40人後自動關閉報名通道

提供易漢博基因科技實習機會或工作機會

課程連報有優惠,具體見報名**

座位按報名並繳費或預付款成功順序從前到後龍擺尾式排序

多人 (n,10>n>1) 組團報名並同時繳費,每人還可減免n-1百元 (最高500)

贈送金士頓u盤乙個(32g含培訓資料和指令碼)

注意事項*

需自備膝上型電腦,推薦使用win10系統,4g以上記憶體(推薦8g)。課程實踐根據需要會提供雲計算平台

培訓班所有資料,文件為內部資料,僅供參閱,未經允許不得翻印外傳登刊

上課期間禁止錄音,錄影

成功付款的學員,若臨時有緊急事情不能到來的,可申請延期,更換後續培訓班;也可申請退款

若開課2周 (含) 前申請退款可退還85%費用;開課3個工作日 (含) 前申請退款退還70%的費用 (若已開發票需承擔相應手續費)

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