今天跟乙個同學討論了絛蟲基因組研究方法，同時我也看到一些同學在用這套策略做枸杞的基因組，我想這應該是真核生物基因組分析一些常用的策略。簡要記錄一下：
常用的軟體有glimer等
然後**基因的家族，用treefarm
然後與相近的物種做乙個進化樹，可以選用28s 18s 58s之間的保守序列做進化樹，當然這些編碼28srrna 18srrna 58srrna的基因也很保守，也可以選取一些保守的基因家族，比如上面提到的18srrna 做進化樹，之所以選擇保守基因，是為了排除外來gene序列的干擾
看進化的各個階段基因家族的增加，減少情況
線粒體和葉綠體的基因組特點 基因和基因組
基因 gene 是能夠編碼蛋白質或者rna等具有特定功能產物的 負載遺傳資訊的基本單位，即有遺傳效應的dn 段 可以理解為 gene protein rna mrna trna rrna 基因組 genome 是指乙個生物體內所有遺傳物質的總和，對於含有線粒體或者葉綠體等結構的生物來說，還包括其中的...
人基因組（一）
人類基因組包含22條染色體和1條x或者y染色體，這些染色體長度為45 279mb，加起來共為3286mb。基於染色體的結構，全部基因可被分為常染色質 euchromatin 區域 通常包含活性基因 和異質染色質 heterochromatin 區域，後者攜帶低密度的活性基因。常染色質組成了基因組的主...
比較基因組學
以 全基因組 測序為目標的 結構基因組學 structural genomics 以 基因功能鑑定 為目標的 功能基因組學 functional genomics 又被稱為後基因組 postgenome 比較基因組學 comparative genomics 是基於基因 譜和測序基礎上，對已知的基因...