植物基因組資料庫

2021-09-29 04:28:13 字數 865 閱讀 2831

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亞細胞定位**(第乙個**很準,使用最新版本**)

研究mirna的資料庫:

mirbase

targetscan

microrna.org

starbase v2.0

pita

pictar

rnahybrid

mirwalk 2.0

diana-microt

mirnamap

deepbase v2.0

幾個植物和動物資料庫**:

air 擬南芥

signal 擬南芥

rarge 擬南芥

rice genome annotation project 水稻

rap-db 水稻

sol genomics network 茄科

gramene 禾本科

graingenes 麥類作物

soybase 大豆

maziegdb 玉公尺

cyanobase 藍細菌

gdr (genome database for rosaceae) 薔薇科

brassica genome gateway 蕓薹

cucurbit genomics database 葫蘆科

phytozome 植物 (全基因組資訊)

plantgdb 植物(全基因組或/大規模 est資訊)

ensemblplants 植物(全基因組資訊)

chloroplastdb 植物(葉綠體基因組)

kegg plant 植物(全基因組或/大規模 est資訊)

線粒體和葉綠體的基因組特點 基因和基因組

基因 gene 是能夠編碼蛋白質或者rna等具有特定功能產物的 負載遺傳資訊的基本單位,即有遺傳效應的dn 段 可以理解為 gene protein rna mrna trna rrna 基因組 genome 是指乙個生物體內所有遺傳物質的總和,對於含有線粒體或者葉綠體等結構的生物來說,還包括其中的...

人基因組(一)

人類基因組包含22條染色體和1條x或者y染色體,這些染色體長度為45 279mb,加起來共為3286mb。基於染色體的結構,全部基因可被分為常染色質 euchromatin 區域 通常包含活性基因 和異質染色質 heterochromatin 區域,後者攜帶低密度的活性基因。常染色質組成了基因組的主...

構建乙個近乎完整的植物基因組

目錄植物基因組大小跨越幾個數量級,倍性和雜合性變化,以及新舊基因組轉座子變化等帶來組裝挑戰。三代和物理圖譜提供了新機會,單倍型定相 結構變異分析 從頭泛基因組研究成為新興組裝熱點。植物基因組發展 在過去20年種,有400多個植物基因組已發表,包括333個被子植物,15個非被子植物 2個輪藻和44個綠...