研究生期間，學習數量遺傳學時，對配合力的概念感到很神奇，曾經和同學討論過，按道理說曹操的一般配合力很高，幾個孩子都很出色。
那麼問題來了，什麼是一般配合力？一般配合力就是可以穩定遺傳的因素，即曹操和不同女性生育的孩子，都很出色，這表明這種出色不因為不同女性的差異而變化，說明這種出色是遺傳自父親，因此曹操的一般配合力比較高。
那麼什麼是特殊配合力呢？看一下曹操的父母，這可以理解為其父母之間的特殊配合力比較高。
同學表示這很偽科學，並表示我這種思想很危險，亂套概念。。。
教科書的定義：
下面通過一篇文獻，介紹一下配合力的計算方法。
兔兔
文獻參考：
adenaike a s, osisanya t o, ogunsola o d, et al. combining ability and inheritance of growth traits in rabbits[j]. journal of biology agriculture & healthcare, 2013.
試驗設計如下：
三個兔子品種，進行雙列雜交（無自交，有正反交），共6個組合，每個組合重複了5次，測量其子代的性狀，評價三個兔子品種的一般配合力和特殊配合力。
資料分析思路：
首先採用方差分析的方法，將其作為固定因子計算一般配合力和特殊配合力效應值，然後作為隨機因子計算方差組分，根據方差組分計算遺傳力。
計算結果：
一般配合力和特殊配合力結果：
這個裡面我們也可以計算配合力的顯著性。
遺傳力的計算：
文章還在用方差分析的形式，計算效應值作為配合力值，這種演算法有缺點，比如有缺失值或者資料不平衡（比如重複不一致），計算不準確。推薦使用混合線性模型，將親本和組合作為隨機因子，可以直接計算方差組分，而且可以將blup值作為配合力。當然，如果使用混合線性模型，就不能得到文章中的配合力的顯著性了。
總結：
配合力計算，無論是動物育種，還是植物育種，都會經常遇到，關鍵是要理解什麼是配合力，以及為什麼要計算配合力。
特殊配合力一般用於劃群，比如劃分父本群和母本群，就是因為這兩個群的特殊配合力比較高，如果我們不斷提高父本群和母本群的一般配合力，而且同時保持兩群的特殊配合力，育種才會不斷的提公升。
什麼？你想看**？
資料描述：
資料：孔繁玲《植物數量遺傳學》第十章（p282頁）例10.8
父本有4個，母本有7個，共有4*7=28個組合（家系），重複2次。
# 沒安裝learnasreml
# devtools::install_github("dengfei2013/learnasreml")
library(learnasreml)
data("ncii")
dat = ncii
str(dat)
# 收費軟體解決方案
library(asreml)
mod = asreml(yield ~ block, random = ~ p1 + p2 + fam, data=dat)
summary(mod)$varcomp
# 廣義遺傳力
pin(mod, hb ~ (v1+v2+v3)/(v1+v2+v3+v4) )
# 狹義遺傳力
pin(mod, h2 ~ (v1+v2)/(v1+v2+v3+v4))
# 配合力
coef(mod)$random
# 免費軟體解決方案
library(sommer)
mod = mmer2(yield ~ block, random = ~ p1 + p2 + fam, data=dat)
summary(mod)
# 廣義遺傳力
pin(mod, hb ~ (v1+v2+v3)/(v1+v2+v3+v4) )
# 狹義遺傳力
pin(mod, h2 ~ (v1+v2)/(v1+v2+v3+v4))
# 配合力
randef(mod)
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