popgene分析方法：
ssr為顯性分子標記，故將實驗分析資料作為單倍型資料進行統計，在某一位點上依據條帶的有或無分別記為1或0，輸入excel表中形成二元資料矩陣。在此資料基礎上進行如下統計分析：多樣性分析，運用popgene version 1.31軟體計算地椒各種群間及種群內全部個體多型位點百分率、種群總基因多樣性（ht）、種群內基因多樣性（hs）、種群間的遺傳分化指數（gst）（gst= 1 - hs/ht）、nei』s 基因多樣性指數（h）、nei』s 遺傳距離和遺傳一致度及shannon多樣性資訊指數（i），並對種群間及種群內個體進行聚類分析。可配合採用arlequin version 3.01軟體包進行amova分析，統計種群內和種群間的方差、方差分量及貢獻率，依此量化評價基因多樣性在種群間和種群內的差異和貢獻，並做差異顯著性檢驗。
shdi（shannon』s diversity index）：夏農多樣性指數。夏農多樣性指數是一種基於資訊理論的測量指數，在群體遺傳分析中應用很廣泛。
公式：h=-σpilnpi
單位：無，範圍：shdi≥0
公式描述：shdi在群體遺傳等於各群體型別大小的比乘以其值的自然對數之後的和的負值。shdi=0表明整個群體高度集中；shdi增大，說明群體較分散或呈均衡化趨勢分布。
群體遺傳學 Fst指數
群體遺傳學中衡量群體間分化程度的指標有很多種，最常用的就是fst指數。fst指數，由f統計量演變而來。f統計量 fis，fif，fst 主要有三種。fst是針對一對等位基因，如果基因座上存在復等位基因，則需要用gst衡量，基因差異分化係數 gene differentiation coefficie...
進化演算法 遺傳演算法
一 能解決的問題 如果你需要解決乙個問題，這個問題的每乙個可能的解均可以用位串來表示，那麼遺傳演算法就能解決這個問題。二 術語 個體 每乙個可能的解 種群 一群個體 基因 個體中位的乙個序列包含著個體的一些特徵資訊，這個序列被稱為基因 染色體 乙個個體中全部基因的集合 基因型 特定的基因被稱為基因型...
群體遺傳 遺傳分化一些基本概念
群體遺傳學中衡量群體間分化程度的指標有很多種，最常用的就是fst指數。fst指數，由f統計量演變而來。f統計量 fis，fif，fst 主要有三種。fst是針對一對等位基因，如果基因座上存在復等位基因，則需要用gst衡量，基因差異分化係數 gene differentiation coefficie...