R語言 3 14 多維標度法MDS

2021-10-03 21:00:17 字數 1576 閱讀 5733

多維標度分析古典函式cmdscale的用法:

cmdscale(d,k=2,…)

d表示進行多維標度分析的距離矩陣,k表示維度,預設取2維

d的古典解

eg根據城市的距離矩陣,在二維平面上把城市標出來

計算出二維座標的十個座標點

畫圖標點

2.非度量法多維標度分析函式isomds的用法

需要呼叫包mass

isomds(d,k=2,…)

d表示距離陣,k表示維度

注意d必須為矩陣,可用函式as.matri將資料框等其他形式轉換成矩陣形式。

壓力指數0.04,小於0.05就非常好

與古典解基本一致

多維標度法的計算過程:

1.確認研究目的

2.選擇樣品和變數

3.計算樣品間的距離矩陣

4.分析樣品間的距離矩陣

5.計算距離陣的古典解

6.檢驗模型的擬合效果

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