library(plantlist)
sp<-c(" phaius fl**us " ,
" thevetia peruviana " ,
" utricularia aurea " ,
" hoya fusca " ,
" isodon sculponeatus " ,
" gonocarpus chinensis " ,
" echinacanthus lofouensis " ,
" tricyrtis pilosa " ,
" oenotheraglazioviana " ,
" senna surattensis " ,
" impatiens siculifer " ,
" vitex negundo " ,
" stauntonia brachyanthera " ,
" boniodendron minus " ,
" coptis chinensis " ,
" pistacia chinensis " ,
" agrimonia pilosa var. nepalensis " ,
" berberis amurensis " ,
" corchorus capsularis " ,
" grewia henryi " ,
" rubus xanthoneurus ") #括號內填物種名，用英文狀態的雙引號和逗號隔開，在excel內列出，無需合併，直接貼上進來。
sp2<-tpl(sp)
res <- taxa.table(sp2)
taxa.table(res)
writelines(res,"taxa.table.txt") # 輸出的是txt格式的檔案。可以做譜系多樣性分析。
setwd("d:\\") #"d:\\"為自己設定的工作空間。
getwd()# 檢視當前的工作空間。
write.table(res,"daochushuju.csv",sep=",")#res是r生成的資料，sample.csv是存到本地的檔名，最後在自己設定的工作空間找到匯出的csv檔案。
###以上可以做譜系多樣性分析。
devtools::install_github("jinyizju/v.phylomaker")
install.packages(v.phylomaker)
library(plantlist)
sp<-c("馬棘", "多花泡花樹", "粗毛牛膝菊") #括號內填物種名，用英文狀態的雙引號和逗號隔開，引號中間不能有空格。在excel內列出，無需合併，直接貼上進來。
res <- ctpl(sp)
taxa.table(res)
writelines(res,"taxa.table.txt") # 輸出的是txt格式的檔案。
setwd("d:\\") #"d:\\"為自己設定的工作空間。
getwd()# 檢視當前的工作空間。
write.table(res,"daochushuju4.csv",sep=",")#res是r生成的資料，sample.csv是存到本地的檔名，最後在自己設定的工作空間找到匯出的csv檔案。
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