一圖了解常用測序及其適用範圍
所謂「遇事不決先測序，經費太多測個序」反應的就是當前測序的火熱程度。測序方法大多使用縮略語，比如說家耳熟能詳的rna-seq，chip-seq和最新火起來的atac-seq。但是大家有沒有想過，當你們說rna-seq時，未必指的是相同乙個生物學問題，有人可能是是定量，有人可能用他找snp 定位基因。甚至有人稍微修改了前人測序在文庫構建時的乙個配方就敢取新的名字。
作者舉出了四個常見的問題：
作者提出了幾個原則
最後整理形成了測序命名百科：
每日文獻 2018 01 10
為了能夠適應環境，植物需要監控自身的代謝途徑，能夠符合當前的生長和防禦。初期代謝產物可以通過遍在保守tor target of rapamycin 通路進行衡量，在有限的能量和影響下平衡生長和發育之間的關係。最新的工作表明，植物能夠先估計防禦性代謝產物，制定好某些策略從而快速將資源重定位到植物生長和...
每日文獻 2018 01 12
每到年終大家都愛做總結,除了我在每日文獻 2018 01 08提到的比對工具年鑑更新到了2017版,各大生物資料中心也開始紛紛做總結,然後發一篇核酸研究nar.這三篇文章的標題和位址如下 地點資料庫名 原文標題 美國ncbi database resources of the national ce...
每日文獻 2018 01 29
這是一篇發表在 briefings in bioinformatics 的文章，這篇文章最大的亮點在於，作者只有乙個人，但是在摘要裡面，他可能害怕寂寞，於是在摘要裡我見到了 we,而不是i，或許他乙個人就是乙個團隊吧。這篇文章的工作等同把乙個公司的流程拿出來發，我們來比較一下公司的流程和他的流程 文...