轉錄組分析是目前可以說最成熟的分析體系，並且已經有有很多的r包可以用來進行資料分析。但是使用這些r包需要你有一定寫指令碼的能力，並且還要懂得如何對原始資料進行處理。為了方便使用者使用， 作者整合了目前開源的r包，開發了乙個網頁工具，相當於給其他r包增加了視覺化介面，用來滿足大家用滑鼠分析資料的渴望。
目前該工作有如下的分析模組：
作者文章還給了幾張很好看的圖，或許你會感興趣
幾個分析模組結果
我覺得要是你都知道如何正確使用這些工具，那你的資料分析能力也就合格了。所以感覺這個包不是給完全新手用，而是給那些寫**累了，用滑鼠點點休息娛樂下的人用。安裝非常的簡單，由於pivot只是對已有的r包進行整合開發，所以僅僅只要保證你先安裝了r，之後就輸入如下命令，等待30分鐘左右即可。
# dependecies that need to be manually installed
install.packages("devtools")
library("devtools")
source("")
bioclite("biocupgrade")
bioclite("go.db")
bioclite("hsmmsinglecell")
bioclite("org.mm.eg.db")
bioclite("org.hs.eg.db")
bioclite("deseq2")
bioclite("singlecellexperiment")
bioclite("scater")
bioclite("monocle")
# install pivot
install_github("qinzhu/pivot")
bioclite("biocgenerics") # you need the latest biocgenerics >=0.23.3
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而我已經因為下面這個問題而放棄了
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專案位址是：
ps 這篇文章是2023年10月發的。
每日文獻 2018 01 10
為了能夠適應環境，植物需要監控自身的代謝途徑，能夠符合當前的生長和防禦。初期代謝產物可以通過遍在保守tor target of rapamycin 通路進行衡量，在有限的能量和影響下平衡生長和發育之間的關係。最新的工作表明，植物能夠先估計防禦性代謝產物，制定好某些策略從而快速將資源重定位到植物生長和...
每日文獻 2018 01 12
每到年終大家都愛做總結,除了我在每日文獻 2018 01 08提到的比對工具年鑑更新到了2017版,各大生物資料中心也開始紛紛做總結,然後發一篇核酸研究nar.這三篇文章的標題和位址如下 地點資料庫名 原文標題 美國ncbi database resources of the national ce...
每日文獻 2018 01 29
這是一篇發表在 briefings in bioinformatics 的文章，這篇文章最大的亮點在於，作者只有乙個人，但是在摘要裡面，他可能害怕寂寞，於是在摘要裡我見到了 we,而不是i，或許他乙個人就是乙個團隊吧。這篇文章的工作等同把乙個公司的流程拿出來發，我們來比較一下公司的流程和他的流程 文...