洛谷1140 相似基因

洛谷1140 相似基因

題目背景

大家都知道，基因可以看作乙個鹼基對序列。它包含了4種核苷酸，簡記作a,c,g,t。生物學家正致力於尋找人類基因的功能，以利用於診斷疾病和發明藥物。 在乙個人類基因工作組的任務中，生物學家研究的是：兩個基因的相似程度。因為這個研究對疾病的**有著非同尋常的作用。

題目描述

兩個基因的相似度的計算方法如下：

對於兩個已知基因，例如agtgatg和gttag，將它們的鹼基互相對應。當然，中間可以加入一些空鹼基-，例如：

這樣,兩個基因之間的相似度就可以用鹼基之間相似度的總和來描述，鹼基之間的相似度如下表所示：

那麼相似度就是：(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。因為兩個基因的對應方法不唯一，例如又有：

相似度為：(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。規定兩個基因的相似度為所有對應方法中，相似度最大的那個。

輸入輸出格式

輸入格式：

共兩行。每行首先是乙個整數，表示基因的長度；隔乙個空格後是乙個基因序列，序列中只含a,c,g,t四個字母。1<=序列的長度<=100。

輸出格式：

僅一行，即輸入基因的相似度。

輸入輸出樣例

輸入樣例#1：

7 agtgatg

5 gttag

輸出樣例#1：

14

【思路】

線性dp。

可以模擬於求最大公共子串行。設d[i][j]為到a串的i與b串的j為止的最大相似度。則有轉移方程：

d[i][j]=max

需要注意的是初始化d[0][j]和d[i][0]，另外字串右移一位讀入方便處理。

【**】

1 #include2 #include3

using
namespace
std;45
const
int maxn = 100+10;6
const
int w[5][5]=,
8 ,
9 ,
10 ,
11 
12};
13int h[333
],d[maxn][maxn];
14int
n,m;
15char
a[maxn],b[maxn];
1617 inline int cost(char x,char
y) 20
21int
main() 
26for(int j=1;j<=m;j++) 
2728
for(int i=1;i<=n;i++)
29for(int j=1;j<=m;j++)
34 printf("%d"
,d[n][m]);
35return0;
36 }

洛谷1140相似基因

兩個基因的相似度的計算方法如下 對於兩個已知基因，例如agtgatg和gttag，將它們的鹼基互相對應。當然，中間可以加入一些空鹼基 例如 這樣,兩個基因之間的相似度就可以用鹼基之間相似度的總和來描述，鹼基之間的相似度如下表所示 那麼相似度就是 3 5 5 2 3 5 3 5 9。因為兩個基因的對應...

洛谷P1140 相似基因

大家都知道，基因可以看作乙個鹼基對序列。它包含了4種核苷酸，簡記作a,c,g,t。生物學家正致力於尋找人類基因的功能，以利用於診斷疾病和發明藥物。在乙個人類基因工作組的任務中，生物學家研究的是 兩個基因的相似程度。因為這個研究對疾病的 有著非同尋常的作用。兩個基因的相似度的計算方法如下 對於兩個已知...

洛谷P1140 相似基因

大家都知道，基因可以看作乙個鹼基對序列。它包含了44種核苷酸，簡記作a,c,g,ta,c,g,t。生物學家正致力於尋找人類基因的功能，以利用於診斷疾病和發明藥物。在乙個人類基因工作組的任務中，生物學家研究的是 兩個基因的相似程度。因為這個研究對疾病的 有著非同尋常的作用。兩個基因的相似度的計算方法如...